Biografía
Inició su trayectoria como guardameta a temprana edad en las categorías inferiores del Xerez Club Deportivo, donde ingresó a los once años. Pasó por los equipos alevín, infantil y juvenil de Primera División Nacional hasta llegar al filial, el Xerez Deportivo B. Finalmente, ascendió al primer equipo en la temporada 1995-96. Durante su etapa formativa destacó por su dedicación, lo que le valió el apodo de «El Tigre de Chapín», acuñado por el periodista deportivo José M. Muñoz en el Diario Marca. Asimismo, Villegas ha destacado públicamente la influencia de su padre, Francisco Villegas, en su desarrollo deportivo.
En 1997, bajo la dirección del entrenador Jordi Fabregat, salió de la comunidad andaluza para fichar por el C. D. Tortosa de la provincia de Tarragona, donde permaneció una temporada. En el año 2000 fue traspasado al Lorca C. F. por 1,5 millones de pesetas. Durante las siguientes temporadas militó en varios equipos de la Región de Murcia, como el Cartagonova, el Águilas C. F. y el Sangonera Atlético.
El entrenador Nico Sosa fue una figura clave en su carrera profesional. En la temporada 2004-05, Sosa lo incorporó a la Unión Deportiva Los Barrios, equipo con el que logró disputar por primera vez en la historia del club un play-off de ascenso a la Segunda División B. Tras dos años en la entidad barreña, firmó por dos temporadas con el Arcos Club de Fútbol.
Posteriormente, jugó en el Jerez Industrial en la temporada 2008-09 y tuvo un breve paso por la U. D. Estepona. En la temporada 2010-11 fichó por la S. D. Logroñés, donde se consolidó como portero titular y aportó veteranía al equipo riojano.
El 8 de agosto de 2013 se unió al Xerez Deportivo FC, club de nueva creación en Jerez de la Frontera, renunciando a una remuneración económica para poder jugar en el equipo de su ciudad.
Tras retirarse del fútbol activo en 2017, pasó a los despachos asumiendo el cargo de director deportivo del propio Xerez D. F. C. y, más adelante, de la A. D. Ceuta F. C., logrando con este último el ascenso a la Segunda División de España.
Homenaje
El que fuera portero de la Unión Deportiva Los Barrios, Edu Villegas, fue homenajeado con motivo del encuentro entre su anterior equipo, el Arcos C.F., y la Unión. Antes, durante y después del partido revivió el cariño del público, además de recibir una placa en recuerdo de sus años de servicio. Aquí se puede ver un vídeo del Homenaje.
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