Jussi Jalonen (s. 16. marraskuuta 1975 Rauma) on suomalainen historioitsija ja tietokirjailija. Hän on Oulun yliopiston sosiaali- ja kulttuurihistorian dosentti.
Jalonen on julkaissut muun muassa jääkärieversti Eino Polónin elämäkerran sekä kirjoittanut artikkelin suojelupoliisin ja puolustusministeriön rahoittamaan tutkimukseen, joka on ilmestynyt Suomi, terrorismi, Supo -nimisenä kirjana. Vuoden 2012 kunnallisvaaleissa hän oli keskustan ehdokkaana Tampereella. Hän sai 31 ääntä eikä tullut valituksi.
Vuonna 2018 Tieteentekijöiden liitto valitsi Jalosen Vuoden tieteentekijäksi.