Leena Inkeri Alhonen (1976–1988 Alhonen-Hongisto; s. 26. heinäkuuta 1953 Helsinki) on suomalainen eläinbioteknologian emeritaprofessori.
Leena Alhonen syntyi teknikko Kalervo Alhosen ja Irja Anna Ester Nupposen perheeseen. Hänen puolisonsa 1976–1988 ja oli Jukka Hongisto ja vuodesta 1989 professori Juhani Jänne (k. 2008). Alhonen tuli ylioppilaaksi Hyvinkään uudesta yhteiskoulusta 1972 ja valmistui Helsingin yliopistosta filosofian kandidaatiksi 1977 ja lisensiaatiksi 1978 ja väitteli siellä filosofian tohtoriksi 1980.
Alhonen oli tutkija San Franciscossa 1982–1983 ja Helsingin yliopistossa assistentti 1981–1988 ja biokemian dosentti 1984–1989 ja vs. apulaisprofessori 1985–1988. Kuopion yliopistossa, sittemmin Itä-Suomen yliopisto, hän oli erikoistutkija 1988–1995, molekyylibiologian dosentti vuodesta 1988, A. I. Virtanen -instituutin tutkimusjohtaja 1995–1998 ja eläinbioteknologian professori vuodesta 1998. Vieraileva tutkija Buffalossa Alhonen oli 1996–1997.