MECP2 (engl. methyl-CpG binding protein 2) on geeni, joka koodaa samannimistä proteiinia. Ihmisillä geeni sijaitsee X-kromosomin pitkässä käsivarressa. Sen koodaama MECP2-proteiini on säätelyproteiini, joka säätelee geenien ilmentymistä. MECP2-geeni on yhdistetty Rettin oireyhtymään ja MECP2-duplikaatio-oireyhtymään.
Rettin oireyhtymä on neurologinen sairaus, jota esiintyy ensisijaisesti naisilla. Se puhkeaa tavallisesti noin puolivuotiaana ja ensioireena on muun muassa kehityksen voimakas taantuminen. Sairauden syy on tavallisesti MECP2-geenin mutaatio, joka aiheuttaa geenin toimimattomuutta. Sairauden vakavuuteen vaikuttaa X-kromosomin inaktivaatio.
MECP2-duplikaatio-oireyhtymä on neurologinen sairaus, jota esiintyy yleensä vain miehillä. Sille tunnusomaisia oireita ovat kehitysvammaisuus, hypotonia, autistiset piirteet, epilepsia ja toistuvat hengitystieinfektioit. Oireyhtymän aiheuttaa Xq28-kromosomialueen kahdentumisesta johtuva MECP2-geenin yli-ilmentyminen.