Seppo Ruotsalainen (s. 1964) on suomalainen virkamies ja suojelupoliisin operatiivinen apulaispäällikkö. Hän on koulutukseltaan hallintotieteiden maisteri, ja on toiminut muun muassa Supon apulaispäällikkönä ja vastatiedustelupäällikkönä.