Timo Kaukonen (s. 19. elokuuta 1965 Rovaniemen maalaiskunta) on oululainen lääkäri ja entinen Suomen Lääkäriliiton puheenjohtaja. Hänet valittiin Suomen Lääkäriliiton puheenjohtajaksi joulukuussa 2008 ja hän toimi tehtävässä vuoden 2011 loppuun. Kaukonen on erikoisalaltaan plastiikkakirurgi, ja hän on työskennellyt muun muassa apulaisylilääkärinä Oulun yliopistollisessa sairaalassa.
Kaukonen on naimisissa Marjo Kaarteenaho-Kaukosen kanssa, ja heillä on kaksi poikaa.