Les « Candidatus Aerophobota » sont un phylum Candidatus (Ca.) du domaine Bacteria. Son nom provient de « Ca. Aerophobus » qui est le genre type de ce phylum.
Ce phylum est proposé en 2013 par C. Rinke et al. pour recevoir l'espèce non cultivable « Ca. Aerophobus profundus ».
Proposé en 2013 sous le nom de « Candidatus Aerophobetes », le nom de ce phylum est considéré comme n'ayant pas de statut nomenclatural ce qu'indiquent les guillemets. Le terme Candidatus signifie qu'il s'agit d'une bactérie non cultivable au moment de sa description. Ce nom initial est considéré comme incorrect et erroné,. Une proposition de renommage en « Candidatus Aerophobota » est alors effectuée et devient le nom préféré – et non pas le nom correct.
L'étymologie du nom actuel de ce phylum est la suivante : A.e.ro.pho.bo’ta. N.L. masc. n. Aerophobus, un nom de genre Candidatus ; L. neut. pl. n. suff. -ota, suffixe définissant un phylum ; N.L. neut. pl. n. Aerophobota, le phylum de Candidatus Aerophobus.