Agathon Note est né le 2 juillet 1937 à Konda, dans la Likouala-Mossaka au Congo français. Il est le fils d'Étienne Note et de Berthe Madzele.
Après ses études primaires, il poursuit sa scolarité secondaire au lycée Savorgnan-de-Brazza à Brazzaville, où il obtient son baccalauréat. Il poursuit ensuite des études à l'École nationale de la France d'outre-mer (ENFOM).
Il commence sa carrière administrative au début des années 1960 dans le domaine du travail.
Le 31 août 1963, il est nommé directeur du travail, de la main-d'œuvre et de la prévoyance sociale,.
En 1966, par décret n°66-253 du 17 août 1966, il est nommé directeur général du travail, entité nouvellement créée,.
En 1967, plusieurs textes officiels mentionnent sa promotion dans le corps des administrateurs des services du travail.
Responsabilités administratives
En 1972, Agathon Note est nommé directeur de l'École nationale d'administration de Brazzaville,.
Par décret n°72-419 du 30 décembre 1972, il est nommé directeur général de la planification de la formation au ministère de l'Enseignement technique, professionnel et supérieur, fonction qu'il exerce cumulativement avec celle de directeur de l'École nationale d'administration,.
Le 31 août 1973, il est nommé directeur de cabinet du Premier ministre, chef du Gouvernement et ministre du Plan Henri Lopes, avec rang et prérogatives de ministre, fonction qu'il exerce jusqu'en 1975.
En 1977, par décret n°77-180 du 21 avril 1977, il est nommé directeur général de l'Office national du commerce (OFNACOM), fonction qu'il exerce jusqu'en 1984,,.
Il est nommé ensuite directeur général de l'Usine des tissus synthétiques.
Parallèlement à ses fonctions dans l'administration publique, il exerce des responsabilités dans le secteur de la santé et dans les organisations professionnelles. Il devient notamment président de la Chambre de commerce, d'industrie, d'agriculture et des métiers de Brazzaville de 1982 à 1983,.
En 1985, par décret n°85-801 du 14 juin 1985, il est nommé inspecteur général d'État. Ce texte fait ensuite l'objet d'un rectificatif en 1986.
En 1989, Agathon Note est nommé directeur général du Centre hospitalier universitaire de Brazzaville.
Responsabilités politiques et institutionnelles
En 1993, Agathon Note devient vice-président de la Commission nationale d'organisation et de supervision des élections législatives anticipées (CONOSELA), avec rang et prérogatives de ministre.
Toujours la même année, il est nommé directeur de cabinet du Premier ministre Jacques Joachim Yhombi-Opango, avec rang et prérogatives de ministre, fonction qu'il occupe jusqu'en 1996,.
En 1997, Agathon Note est Président du Conseil constitutionnel de la république du Congo,.
