Les Apusozoa sont un groupe d'organismes unicellulaires très simples. Une centaine d'espèces est connue. La position des Apusozoa dans les eucaryotes reste discutée, à la base des bicontes ou à proximité des amibozoaires, ainsi que le caractère monophylétique du groupe.
T. Cavalier-Smith, «Amoeboflagellates and mitochondrial cristae in eukaryote evolution: megasystematics of the new protozoan subkingdoms eozoa and neozoa», Archiv für Protistenkunde, vol.147, nos3-4, , p.237–258 (ISSN0003-9365, DOI10.1016/S0003-9365(97)80051-6, lire en ligne, consulté le )
Cavalier-Smith, Chao, Stechmann, Oates & Nikolaev, 2008 Planomonadida ord. nov. (Apusozoa): Ultrastructural Affinity with Micronuclearia podoventralis and Deep Divergences within Planomonas gen. nov. Protist Volume 159, Issue 4, 21 October 2008, Pages 535-562