Le genreAvahi était anciennement monotypique avec une seule espèce (Avahi laniger), comprenant une variété orientale et une variété occidentale. Celles-ci ont été élevées au rang d'espèces à part entière en 1990 (Avahi laniger et Avahi occidentalis). En 2000, une troisième espèce (Avahi unicolor) est décrite à partir d'individus découverts dans la région de la péninsule d'Ampasindava. Récemment, plusieurs nouvelles espèces ont été proposées et le statut du genre est actuellement sujet à de nombreuses controverses taxinomiques:
2005: Avahi de Cleese (Avahi cleesei), baptisée en l'honneur de John Cleese, acteur des Monty Python qui a joué un gardien de zoo amoureux des lémuriens dans Créatures féroces en 1997 puis consacré un documentaire à ces animaux l'année suivante. Ce taxon pourrait n'être qu'un synonyme de A. occidentalis.
2006: Avahi de Peyriéras (Avahi peyrierasi) et Avahi méridional (Avahi meridionalis).
2007: Avahi de Manombo (Avahi ramanantsoavanai), d'abord considéré comme une sous-espèce de A. meridionalis, et Avahi du Betsileo (Avahi betsileo).
↑(en) Y. Rumpler, S. Warter, C. Rabarivola, J. J. Petter et B. Dutrillaux, «Chromosomal evolution in Malagasy lemurs: XII. Chromosomal banding study of Avahi laniger occidentalis (Syn: Lichanotus laniger occidentalis) and cytogenetic data in favour of its classification in a species apart—Avahi occidentalis», American Journal of Primatology, vol.21, , p.307–316 (DOI10.1002/ajp.1350210406)
↑(en) U. Thalmann et T. Geissmann, «Distribution and geographic variation in the western wooly lemur (Avahi occidentalis) with description of a new species (A. unicolor)», International Journal of Primatology, vol.21, , p.915-941
↑(en) U. Thalmann et T. Geissmann, «New species of woolly lemur Avahi (Primates: Lemuriformes) in Bemaraha (Central Western Madagascar)», American Journal of Primatology, vol.67, no3, , p.371–376 (DOI10.1002/ajp.20191)
↑(en) A. Zaramody, J.-L. Fausser, C. Roos, D. Zinner, N. Andriaholinirina, C. Rabarivola, I. Norscia, I. Tattersall et Y Rumpler, «Molecular phylogeny and taxonomic revision of the eastern woolly lemur (Avahi laniger)», Primate Report, vol.74, , p.9–22
↑(en) R. Andriantompohavana, R. Lei, J. R. Zaonarivelo, S. E. Engberg, G. Nalanirina, S. M. McGuire, G. D. Shore, J. Andrianasolo, K. Herrington, R. A. Brenneman et E. E. Louis Jr., «Molecular phylogeny and taxonomic revision of the woolly lemurs, Genus Avahi (Primates: Lemuriformes)», Special Publications of the Museum of Texas Tech University, vol.51, , p.1–64 (lire en ligne)
↑(en) R. Lei, S.E. Engberg, R. Andriantompohavana, S.M. McGuire, R.A. Mittermeier, J.R. Zaonarivelo, R.A. Brenneman et E.E. Louis Jr., «Nocturnal Lemur Diversity at Masoala National Park», Special Publications of the Museum of Texas Tech University, vol.53, , p.1–48 (lire en ligne)