| Règne | Animalia |
|---|---|
| Embranchement | Arthropoda |
| Sous-embr. | Chelicerata |
| Classe | Arachnida |
| Ordre | Araneae |
| Sous-ordre | Araneomorphae |
| Famille | Amaurobiidae |
| Genre | Callobius |
Callobius yakushimensis est une espèce d'araignées aranéomorphes de la famille des Amaurobiidae.
Cette espèce est endémique de Yaku-shima dans les îles Ōsumi dans l'archipel Nansei au Japon,.
Le mâle holotype mesure 5,0 mm et la femelle paratype 5,0 mm.
Son nom d'espèce, composé de yakushim[a] et du suffixe latin -ensis, « qui vit dans, qui habite », lui a été donné en référence au lieu de sa découverte, Yaku-shima.