Centrolene muelleri est une espèce d'amphibiens de la famille des Centrolenidae.
Cette espèce est endémique de la province de Rioja dans la région de San Martín au Pérou. Elle se rencontre à 2 000 m d'altitude dans la cordillère Orientale.
Le mâle holotype mesure 23,5 mm
Cette espèce est nommée en l'honneur de Paul S. Müller de l'Université de la Sarre.