Chthonius trebinjensis est une espèce de pseudoscorpions de la famille des Chthoniidae.
Cette espèce se rencontre en Bosnie-Herzégovine et en Croatie.
Son nom d'espèce, composé de trebinj[e] et du suffixe latin -ensis, « qui vit dans, qui habite », lui a été donné en référence au lieu de sa découverte, Trebinje.