En 1998 et 1999, douze équipes participèrent à la compétition. Ces équipes étaient divisées en trois groupes de quatre équipes chacun. Les matchs étaient joués en deux manches, aller-retour (comme un mini-championnat). Le champion de chaque groupe et le meilleur second étaient qualifiés pour les demi-finales qui se jouaient en matchs aller-retour, comme les finales. En 1999, les équipes boliviennes participèrent à une phase qualificative avant le premier tour de la Copa Merconorte.
En 2000 et 2001, seize équipes prirent part au tournoi, soit quatre groupes de quatre. Les matchs furent, là encore, joués par matchs aller-retour mais seuls les champions de chaque groupe se qualifièrent pour les demi-finales. Pour celle-ci et la finale, le système en matchs aller-retour fut conservé.