| Règne | Animalia |
|---|---|
| Embranchement | Arthropoda |
| Sous-embr. | Chelicerata |
| Classe | Arachnida |
| Ordre | Araneae |
| Sous-ordre | Araneomorphae |
| Famille | Cybaeidae |
| Genre | Cybaeus |
Cybaeus nagaiae est une espèce d'araignées aranéomorphes de la famille des Cybaeidae.
Cette espèce est endémique de la préfecture de Kyoto sur Honshū au Japon,. Elle se rencontre à Kyōtango.
Le mâle holotype mesure 3,15 mm et la femelle paratype mesure 3,25 mm.