Emoia baudini est une espèce de sauriens de la famille des Scincidae.
Cette espèce est endémique d'Indonésie. Elle se rencontre dans la péninsule de Doberai en Papouasie occidentale, au Sulawesi, à Waigeo, à Ternate, à Buru et dans les îles Aru.
Cette espèce est nommée en l'honneur de Nicolas Baudin.