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La marque remonte à 1903 lorsque Charles Heudebert, artisanboulanger à Nanterre, rue du Chemin-de-Fer (actuellement rue Maurice-Thorez), eut l'idée de recuire le pain invendu de sa boulangerie familiale après l'avoir tranché pour produire des biscottes.
Très vite, le succès s'affirme, la production s’accélère et se diversifie avec l’ouverture d’une usine en 1910 à Nanterre. Ses biscottes étaient alors distribuées dans les boulangeries, les pharmacies et les alimentations générales.
1912: mise au point d'un pain très longue conservation: le « pain de guerre » qui intéressa grandement le ministère de la Guerre.
1919: la marque Heudebert réunit de nombreux produits: laits en poudre et aliments pour enfants, bouillons, céréales, cafés et biscottes.
1968: création du groupe LU-Brun avec Biscuiterie L'Alsacienne.
1972: Heudebert rachète le fabricant de pain grillé Pelletier (fabricant depuis 1896).
1973: ouverture d'une nouvelle unité de production à Granville.
1974: Céraliment s'empare du tiers des parts de LU. Le nouveau groupe est baptisé Céraliment LU Brun et réunit 18 entreprises.
1977: Heudebert est une division de la société Générale Biscuit France (GBF) contrôlée par le groupe français Générale Biscuits (GB).
1986: rachat du groupe Générale Biscuit par BSN futur Danone.
2001: toute la production Heudebert passe sous la marque LU. Heudebert n'est plus que le nom d'une gamme de produits LU.
2007: Danone vend sa division biscuits à l'Américain Kraft Foods, filiale de Philip Morris.
2012: Kraft Foods est scindé en 2 sociétés. Celle à laquelle Heudebert, comme toutes les sociétés de l'ex branche Biscuits de Danone, est rattachée prend le nom de Mondelez.