Avant de devenir préfecture, Malapouyah était une sous-préfecture rattachée à la préfecture de Boké dans la région de Boké. Depuis le 20 août 2026, elle est érigée en préfecture et rattachée à la région de Boké,.
Population
En 2016, la localité comptait 10 985 habitants.
Le , les résultats du recensement général de la population et de l’habitation (RGPH-4) de 2025 ont révélé que, depuis 2016, la population de la sous-préfecture de Malapouyah a connu une augmentation. Elle est désormais estimée à 16 629 habitants, dont 8 232 hommes, soit 49,5%, et 8 397 femmes, soit 50,5%,.