Marinobacter

Classification LPSN
Domaine	Bacteria
Embranchement	Pseudomonadota
Classe	Gammaproteobacteria
Ordre	Alteromonadales
Famille	Alteromonadaceae

Marinobacter est un genre bactéries halotolérantes à Gram négatif de la famille des Alteromonadaceae.

Historique

La recherche de bactéries capables de dégrader les hydrocarbures, le long des côtes françaises, a conduit à l'isolement d'une souche d'abord appelée Alteromonas souche SP.17 à proximité d'une raffinerie pétrolière. Sa caractérisation a démontré qu'il s'agit d'une souche appartenant à une nouvelle espèce qui a été appelée Marinobacter hydrocarbonoclasticus au sein du nouveau genre bactérien Marinobacter.

Description

Les bactéries du genre Marinobacter sont des bactéries à Gram-négatif. Ce sont des bacilles généralement de 0,6à 0,8 μm de large pour 1,6 à 2 μm de long.

Taxonomie

Le nom correct complet (avec auteur) de ce taxon est Marinobacter Gauthier et al., 1992^,.

Étymologie

L'étymologie de ce genre Marinobacter est la suivante : Ma.ri.no.bac.ter. L. masc. adj. marinus, de la mer, marin; N.L. masc. n. bacter, bacille; N.L. masc. n. Marinobacter, bacille de la mer. Le nouveau nom a été validé également en 2019 par l'ICSP.

Phylogénie

L'analyse phylogénique des séquences du 16S rRNA de 500 espèces bactériennes a permis de montrer que la souche SP.17 représente une espèce distincte des espèces Pseudomonas aeruginosa, Marinomonas vaga, Oceanospirillum linum et Halomonas elongata et qu'elle représente aussi sous le nom de M. hydrocarbonoclasticus, l'espèce type d'un nouveau genre.

Liste des espèces

Selon LPSN (3 avril 2023) :

Marinobacter adhaerens Kaeppel et al. 2012
Marinobacter alexandrii Yang et al. 2022
Marinobacter algicola Green et al. 2006
Marinobacter antarcticus Liu et al. 2012
Marinobacter aquaticus León et al. 2017
Marinobacter aromaticivorans Cui et al. 2016
Marinobacter bohaiensis Xu et al. 2018
Marinobacter bryozoorum Romanenko et al. 2005
Marinobacter changyiensis Li et al. 2020
Marinobacter confluentis Park et al. 2015
Marinobacter daepoensis Yoon et al. 2004
Marinobacter daqiaonensis Qu et al. 2011
Marinobacter denitrificans Zhang et al. 2020
Marinobacter excellens Gorshkova et al. 2003
Marinobacter flavimaris Yoon et al. 2004
Marinobacter fonticola Sun et al. 2020
Marinobacter fuscus Liu et al. 2018
Marinobacter goseongensis Roh et al. 2008
Marinobacter gudaonensis Gu et al. 2007
Marinobacter guineae Montes et al. 2008
Marinobacter halodurans Yoo et al. 2020
Marinobacter halophilus Zhong et al. 2015
Marinobacter halotolerans Kim et al. 2017
Marinobacter koreensis Kim et al. 2006
Marinobacter lacisalsi Aguilera et al. 2009
Marinobacter lipolyticus Martín et al. 2003
Marinobacter litoralis Yoon et al. 2003
Marinobacter lutaoensis Shieh et al. 2003
Marinobacter mangrovi Yi et al. 2021
Marinobacter maritimus Shivaji et al. 2005
Marinobacter maroccanus Boujida et al. 2019
Marinobacter mobilis Huo et al. 2008
Marinobacter nauticus (Baumann et al. 1972) Tindall 2020
Marinobacter nitratireducens Vaidya et al. 2015
Marinobacter orientalis Lian et al. 2022
Marinobacter oulmenensis Kharroub et al. 2011
Marinobacter pelagius Xu et al. 2008
Marinobacter persicus Bagheri et al. 2013
Marinobacter profundi Cao et al. 2019
Marinobacter psychrophilus Zhang et al. 2008
Marinobacter salarius Ng et al. 2015
Marinobacter salexigens Han et al. 2017
Marinobacter salicampi Yoon et al. 2007
Marinobacter salinexigens Ahmad et al. 2020
Marinobacter salinus Rani et al. 2017
Marinobacter salsuginis Antunes et al. 2007
Marinobacter santoriniensis Handley et al. 2009
Marinobacter sediminum Romanenko et al. 2005
Marinobacter segnicrescens Guo et al. 2007
Marinobacter shengliensis Luo et al. 2015
Marinobacter similis Ng et al. 2015
Marinobacter szutsaonensis Wang et al. 2009
Marinobacter vinifirmus Liebgott et al. 2006
Marinobacter vulgaris Zhang et al. 2020
Marinobacter xestospongiae Lee et al. 2012
Marinobacter zhanjiangensis Zhuang et al. 2012
Marinobacter zhejiangensis Huo et al. 2008

Espèces publiées de manière non valides

Marinobacter alkaliphilus Takai et al. 2005
Marinobacter arcticus Button et al. 1998
Marinobacter arenosus Lee et al. 2022
Marinobacter atlanticus Bird et al. 2018
Marinobacter caseinilyticus Nie et al. 2021
Marinobacter gelidimuriae Chua et al. 2018
Marinobacter kribbensis Zhu et al. 2010
Marinobacter manganoxydans Wang et al. 2012
Marinobacter marinus Jiang et al. 2006
Marinobacter nanhaiticus Gao et al. 2013
Marinobacter piscensis Hedi et al. 2015
Marinobacter squalenivorans Rontani et al. 2003
Marinobacter subterrani Bonis & Gralnick 2015

Espèces synonymes

Marinobacter aquaeolei (Nguyen et al. 1999) est synonyme de Marinobacter nauticus.
Marinobacter hydrocarbonoclasticus (Gauthier et al. 1992) qui était la souche type du genre est un synonyme de Marinobacter nauticus.

Liens externes

Sur les autres projets Wikimedia :

Marinobacter, sur Wikispecies

Ressources relatives au vivant :
Ressource relative à la santé :
- Medical Subject Headings
(en) BioLib : Marinobacter Gauthier, Lafay, Christen, Fernandez, Acquaviva, Bonin & Bertrand, 1992 (consulté le 3 avril 2023)
(en) Catalogue of Life : Marinobacter Gauthier et al., 1992 (consulté le 3 avril 2023)
(fr + en) EOL : Marinobacter (consulté le 3 avril 2023)
(fr) INPN : Marinobacter Gauthier, Lafay, Christen, Fernandez, Acquaviva, Bonin & Bertrand, 1992 (TAXREF) (consulté le 3 avril 2023)
(en) Taxonomicon : Marinobacter Gauthier et al. 1992 (consulté le 3 avril 2023)

Notes et références

1 2 3 Gauthier et et al. 1992, p. 568.
↑ GBIF Secretariat. GBIF Backbone Taxonomy. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/39omei accessed via GBIF.org, consulté le 3 avril 2023.
↑ (en) « Species Marinobacter aromaticivorans », sur LPSN, 3 avril 2023
↑ (en) « Genus Marinobacter », sur LPSN, 3 avril 2023
↑ (en) Anonymous, « Notification that new names and new combinations have appeared in volume 42, part 4 of the IJSB », Int J Syst Bacteriol, vol. 43, n^o 1,‎ 1^er janvier 1993, p. 189 (DOI 10.1099/00207713-43-1-189)
↑ Gauthier et et al. 1992, p. 572.
↑ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 3 avril 2023.
↑ (en) MC Marquez et A. Ventosa, « Marinobacter hydrocarbonoclasticus Gauthier et al. 1992 and Marinobacter aquaeolei Nguyen et al. 1999 are heterotypic synonyms. », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 55,‎ 1^er mai 2005, p. 1349-1351 (DOI 10.1099/ijs.0.63591-0)

Bibliographie

(en) M. J. Gauthier, B. Lafay, R. Christen, L. Fernandez, M. Acquaviva, P. Bonin et J.-C. Bertrand, « Marinobacter hydrocarbonoclasticus gen. nov., sp. nov., a New, Extremely Halotolerant, Hydrocarbon-Degrading Marine Bacterium », Int J Syst Bacteriol, vol. 42, n^o 4,‎ 1^er octobre 1992, p. 568-576 (DOI 10.1099/00207713-42-4-568)

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[Gauthieret_al.1992568-1] 1 2 3 Gauthier et et al. 1992, p. 568.

[GBIF3_avril_2023-2] GBIF Secretariat. GBIF Backbone Taxonomy. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/39omei accessed via GBIF.org, consulté le 3 avril 2023.

[LPSNMaroma-3] (en) « Species Marinobacter aromaticivorans », sur LPSN, 3 avril 2023

[LPSNMarino-4] (en) « Genus Marinobacter », sur LPSN, 3 avril 2023

[5] (en) Anonymous, « Notification that new names and new combinations have appeared in volume 42, part 4 of the IJSB », Int J Syst Bacteriol, vol. 43, n^o 1,‎ 1^er janvier 1993, p. 189 (DOI 10.1099/00207713-43-1-189)

[Gauthieret_al.1992572-6] Gauthier et et al. 1992, p. 572.

[LPSN3_avril_2023-7] List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 3 avril 2023.

[8] (en) MC Marquez et A. Ventosa, « Marinobacter hydrocarbonoclasticus Gauthier et al. 1992 and Marinobacter aquaeolei Nguyen et al. 1999 are heterotypic synonyms. », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 55,‎ 1^er mai 2005, p. 1349-1351 (DOI 10.1099/ijs.0.63591-0)