Sportif-soldat, Matthias Bischl éprouve des difficultés à émerger en équipe nationale du fait de problèmes de santé.
Sa première saison au niveau international a lieu en 2011-2012, démarrant dans l'IBU Cup et les Championnats d'Europe, où il remporte la médaille d'or avec le relais.
Il fait ses débuts en Coupe du monde en à Hochfilzen, à la suite de son podium en IBU Cup à Idre. En , il marque ses premiers points en Coupe du monde à Khanty-Mansiïsk avec une 37e place au sprint. Lors de l'hiver 2016-2017, il prend part à plusieurs étapes de la Coupe du monde de manière consécutive, obtenant une seizième place au sprint de Ruhpolding notamment.