Microbisium pygmaeum est une espèce de pseudoscorpions de la famille des Neobisiidae.
Cette espèce se rencontre au Japon et en Corée du Sud.
Cette espèce a été décrite sous le protonyme Obisium pygmaeum par Ellingsen en 1907. Elle est placée dans le genre Microbisium par Beier en 1932.