Protowithius fernandezianus est une espèce de pseudoscorpions de la famille des Withiidae.
Cette espèce est endémique de l'archipel Juan Fernández au Chili. Elle se rencontre sur l'île Alejandro Selkirk.
Le mâle mesure 2,7 mm et la femelle 3 mm.
Son nom d'espèce lui a été donné en référence au lieu de sa découverte, l'archipel Juan Fernández.