Rattus baluensis est une espèce de rongeurs de la famille des Muridae, du genre Rattus, endémique de Malaisie.
L'espèce est décrite pour la première fois par le mammalogiste anglais Michael Rogers Oldfield Thomas en 1894.
L'espèce est endémique de Malaisie et se rencontre dans les forêts tropicales humides du mont Kinabalu dans le nord de Bornéo entre 1 524 et 3 810 m d'altitude.
L'Union internationale pour la conservation de la nature la distingue comme espèce de « Préoccupation mineure » (LC) sur sa liste rouge.