SATB1

SATB1
Structures disponibles
PDB	Recherche d'orthologue : PDBe RCSB
Identifiants PDB
	1YSE, 2L1P, 2O49, 2O4A, 3NZL, 3TUO, 2MW8
Identifiants
Alias	SATB1
IDs externes	OMIM: 602075 MGI: 105084 HomoloGene: 2232 GeneCards: SATB1
Position du gène (humain)
Chr.	Chromosome 3 humain
Fin	18,445,588 bp
Position du gène (souris)
Chr.	Chromosome 17 (souris)
Fin	52,140,318 bp
Expression génique
	Fortement exprimé dans
	cortex orbitofrontal; ; frontal pole; ; thymus; ; Brodmann area 46; ; lobe pariétal; ; gyrus postcentral; ; parotide; ; Brodmann area 10; ; cortex entorhinal; ; Brodmann area 23;
	Fortement exprimé dans
	thymus; ; molaire; ; barrel cortex; ; zygote; ; secondary oocyte; ; Rostral migratory stream; ; substantia nigra; ; glande lacrymale; ; muscle vaste latéral; ; sang;
	Plus de données d'expression de référence
	Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire	liaison ADN; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; liaison de chromatine; liaison protéique; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; double-stranded DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; sequence-specific DNA binding;
Composant cellulaire	PML body; matrice nucléaire; nucléoplasme; chromatine; noyau; corps nucléaire;
Processus biologique	réflexe; CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation; CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation; Remodelage de la chromatine; activated T cell proliferation; regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; organisation de la chromatine; transcription, DNA-templated; epidermis development; histone methylation; viral process; T cell activation;
	Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
	6304
	20230
	ENSG00000182568
	ENSMUSG00000023927
	Q01826
	Q60611
NM_001131010; NM_001195470; NM_002971; NM_001322871; NM_001322872;
	NM_001322873; NM_001322874; NM_001322875; NM_001322876
NM_001163630; NM_001163631; NM_001163632; NM_009122; NM_001357636;
	NM_001357637; NM_001357638; NM_001357640
NP_001124482; NP_001182399; NP_001309800; NP_001309801; NP_001309802;
	NP_001309803; NP_001309804; NP_001309805; NP_002962
NP_001157102; NP_001157103; NP_001157104; NP_033148; NP_001344565;
	NP_001344566; NP_001344567; NP_001344569
	Wikidata
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La protéine 1 de liaison aux séquences riches en AT (en anglais special AT-rich sequence-binding protein-1, SATB1) est une protéine codée chez l'humain par le gène SATB1.

Fonction

SATB1 est un facteur de transcription et un organisateur global de la chromatine, qui a émergé comme un facteur clef dans l'intégration de l'architecture de la chromatine par l'intermédiaire de régulation de l'expression génique. Des études récentes ont révélé le rôle de SATB1 dans l'organisation de la chromatine loopscape et sa nature dynamique en réponse à des stimulations physiologiques. À niveau du génome, SATB1 semble jouer un rôle important dans l'organisation de la chromatine transcriptionnellement active. SATB1 organise le locus du CMH-I en diverses boucles de la chromatine, moyennant le recrutement de MARs à la matrice nucléaire à une distance fixe. Le silençage de SATB1 mime les effets du traitement avec l'interféron gamma dans l'architecture de la chromatine du locus du CMH-I, et altère l'expression de gènes à l'intérieur de ce locus. SATB1 aussi semble induire le cancer du sein et métastases en raison de l'altération de l'expression de nombreux gènes.

Interactions

La protéine SATB1 a démontré être capable d'interagir avec:

BAZ1A,
CHD4,
CUTL1,
HDAC1,
MTA2,
POLR2J
SMARCA5.

Notes et références

1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000182568 - Ensembl, May 2017
1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000023927 - Ensembl, May 2017
↑ « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
↑ « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
↑ « Entrez Gene: SATB1 SATB homeobox 1 »
↑ K. Pavan, P. umar, P. K. Purbey, C. K. Sinha, D. Notani, A. Limaye, R. S. Jayani et S. Galande, « Phosphorylation of SATB1, a global gene regulator, acts as a molecular switch regulating its transcriptional activity in vivo », Molecular Cell, vol. 22, n^o 2,‎ avril 2006, p. 231–43 (PMID 16630892, DOI 10.1016/j.molcel.2006.03.010)
↑ S. Galande, P. K. Purbey, D. Notani et P. P. Kumar, « The third dimension of gene regulation: organization of dynamic chromatin loopscape by SATB1 », Current Opinion in Genetics & Development, vol. 17, n^o 5,‎ octobre 2007, p. 408–14 (PMID 17913490, DOI 10.1016/j.gde.2007.08.003)
1 2 3 4 5 D. Yasui, M. Miyano, S. Cai, P. Varga-Weisz et T. Kohwi-Shigematsu, « SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances », Nature, vol. 419, n^o 6907,‎ octobre 2002, p. 641–5 (PMID 12374985, DOI 10.1038/nature01084)
↑ J. Liu, A. Barnett, E. J. Neufeld et J. P. Dudley, « Homeoproteins CDP and SATB1 interact: potential for tissue-specific regulation », Molecular and Cellular Biology, vol. 19, n^o 7,‎ juillet 1999, p. 4918–26 (PMID 10373541, PMCID 84297, DOI 10.1128/mcb.19.7.4918)
↑ L. K. Durrin et T. G. Krontiris, « The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11 », Genomics, vol. 79, n^o 6,‎ juin 2002, p. 809–17 (PMID 12036295, DOI 10.1006/geno.2002.6772)

Liens externes

www.uniprot.org : fiche de la protéine SATB1 sur la banque de données UniProt.
Ressource relative à la santé :
- Héritage mendélien chez l'humain

Portail de la biologie cellulaire et moléculaire

[refGRCh38Ensembl-1] 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000182568 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000023927 - Ensembl, May 2017

[3] « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine

[4] « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine

[entrez-5] « Entrez Gene: SATB1 SATB homeobox 1 »

[pmid16630892-6] K. Pavan, P. umar, P. K. Purbey, C. K. Sinha, D. Notani, A. Limaye, R. S. Jayani et S. Galande, « Phosphorylation of SATB1, a global gene regulator, acts as a molecular switch regulating its transcriptional activity in vivo », Molecular Cell, vol. 22, n^o 2,‎ avril 2006, p. 231–43 (PMID 16630892, DOI 10.1016/j.molcel.2006.03.010)

[pmid17913490-7] S. Galande, P. K. Purbey, D. Notani et P. P. Kumar, « The third dimension of gene regulation: organization of dynamic chromatin loopscape by SATB1 », Current Opinion in Genetics & Development, vol. 17, n^o 5,‎ octobre 2007, p. 408–14 (PMID 17913490, DOI 10.1016/j.gde.2007.08.003)

[pmid12374985-8] 1 2 3 4 5 D. Yasui, M. Miyano, S. Cai, P. Varga-Weisz et T. Kohwi-Shigematsu, « SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances », Nature, vol. 419, n^o 6907,‎ octobre 2002, p. 641–5 (PMID 12374985, DOI 10.1038/nature01084)

[pmid10373541-9] J. Liu, A. Barnett, E. J. Neufeld et J. P. Dudley, « Homeoproteins CDP and SATB1 interact: potential for tissue-specific regulation », Molecular and Cellular Biology, vol. 19, n^o 7,‎ juillet 1999, p. 4918–26 (PMID 10373541, PMCID 84297, DOI 10.1128/mcb.19.7.4918)

[pmid12036295-10] L. K. Durrin et T. G. Krontiris, « The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11 », Genomics, vol. 79, n^o 6,‎ juin 2002, p. 809–17 (PMID 12036295, DOI 10.1006/geno.2002.6772)