SPI1

SPI1
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue : PDBe RCSB Identifiants PDB 1PUE
Identifiants
Alias	SPI1
IDs externes	OMIM: 165170 MGI: 98282 HomoloGene: 2346 GeneCards: SPI1
Position du gène (humain) Chr. Chromosome 11 humain Locus 11p11.2 Début 47,354,860 bp Fin 47,378,547 bp
Position du gène (souris) Chr. Chromosome 2 (souris) Locus 2 E1|2 50.44 cM Début 90,912,735 bp Fin 90,946,101 bp
Expression génique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans granulocyte monocyte poumon droit upper lobe of left lung rate sang cellule de la moelle osseuse appendice iléo-cæcal artère coronaire droite ganglion lymphatique Fortement exprimé dans granulocyte tibiofemoral joint ganglion mésentérique stroma of bone marrow rate sang medulla of thymus embryon lèvre articulation talo-crurale Plus de données d'expression de référence BioGPS Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology Fonction moléculaire liaison ADN sequence-specific DNA binding DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific liaison protéique liaison ARN transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding DNA-binding transcription factor activity NFAT protein binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific transcription factor binding Composant cellulaire noyau nucléoplasme transcription regulator complex Processus biologique myeloid leukocyte differentiation regulation of transcription, DNA-templated cellular response to ethanol somatic stem cell population maintenance lymphocyte differentiation regulation of erythrocyte differentiation myeloid dendritic cell differentiation negative regulation of transcription by RNA polymerase II negative regulation of MHC class II biosynthetic process lymphoid progenitor cell differentiation transcription, DNA-templated macrophage differentiation anatomical structure regression negative regulation of histone H4 acetylation negative regulation of gene expression, epigenetic vasculature development granulocyte differentiation apoptotic process involved in blood vessel morphogenesis histone H3 acetylation erythrocyte differentiation hypermethylation of CpG island positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II positive regulation of transcription by RNA polymerase II negative regulation of transcription, DNA-templated régulation positive de la transcription dépendante de l'ADN regulation of transcription by RNA polymerase II pri-miRNA transcription by RNA polymerase II différenciation cellulaire interleukin-6-mediated signaling pathway Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 6688 20375 Ensembl ENSG00000066336 ENSMUSG00000002111 UniProt P17947 P17433 RefSeq (mRNA) NM_001080547 NM_003120 NM_011355 NM_001378898 NM_001378899 RefSeq (protéine) NP_001074016 NP_003111 NP_035485 NP_001365827 NP_001365828 Localisation (UCSC) Chr 11: 47.35 – 47.38 Mb Chr 2: 90.91 – 90.95 Mb Publication PubMed
Wikidata
Voir/Editer Humain Voir/Editer Souris

Le facteur de transcription PU.1 est une protéine codée par le gène SPI1 chez l'homme.

Fonction

Ce gène code un facteur de transcription à domaine ETS qui active l'expression des gènes au cours du développement des cellules myéloïdes et lymphoïdes B. Le protéine nucléaire se lie à une séquence riche en purines connue sous le nom de PU-box située à proximité des promoteurs des gènes cibles, et régule leur expression en coordination avec d'autres facteurs de transcription et de cofacteurs. La protéine peut également réguler l'épissage alternatif des gènes cibles. Plusieurs variants de transcription codant différents isoformes ont été trouvés pour ce gène.

Interactions

SPI1 interagit avec:

• FUS,
• GATA2,
• IRF4^,, et
• NONO.

En médecine

Une mutation du gène, avec perte d'activité, est observée dans certaines leucémie aiguës myéloblastiques, dont les formes promyélocytaires.

Voir aussi

• Elément régulateur 5' UTR Spi-1 (PU.1)

Notes et références

Liens externes

• FactorBook PU.1

v · m Expression des gènes
Introduction à la génétique	Théorie fondamentale de la biologie moléculaire ADN ARN ARNm Protéine Code génétique Biosynthèse des protéines
Transcription	Régulation de la transcription Facteurs de transcription Facteur trans Facteur cis ARN-polymérase Promoteur Amplificateur Inactivateur Activation CRISPR Site d'initiation de la transcription Atténuation transcriptionnelle Régulation post-transcriptionnelle Modifications post-transcriptionnelles Édition Épissage Épissage alternatif Polyadénylation Dégradation des ARNm non-sens Interférence par ARN Micro-ARN
Traduction	Régulation de la traduction Facteurs d'initiation PABP Ribosome ARNt IRES Coiffe Régulation post-traductionnelle Modifications post-traductionnelles (ajout de groupe fonctionnels, peptidiques, modifications structurelles ou chimiques ; par exemple : phosphorylation) Protéolyse
Contrôle épigénétique	Extinction de gène CRISPRoff et CRISPRon Méthylation de l'ADN Code des Histones Gène Hox Gène soumis à empreinte Réseaux de régulation génique

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