| Règne | Animalia |
|---|---|
| Embranchement | Arthropoda |
| Sous-embr. | Chelicerata |
| Classe | Arachnida |
| Ordre | Araneae |
| Sous-ordre | Araneomorphae |
| Famille | Oonopidae |
| Genre | Scaphios |
Scaphios wagra est une espèce d'araignées aranéomorphes de la famille des Oonopidae.
Cette espèce est endémique de la province de Napo en Équateur,. Elle se rencontre à Sacha Wagra à 665 m d'altitude dans la cordillère Orientale.
La femelle holotype mesure 1,83 mm.
Cette espèce est nommée en référence au lieu de sa découverte, Sacha Wagra.