Sphingobacterium

Classification LPSN
Domaine	Bacteria
Règne	Pseudomonadati
Phylum	Bacteroidota
Classe	Sphingobacteriia
Ordre	Sphingobacteriales
Famille	Sphingobacteriaceae

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Sphingobacterium est un genre de bacilles Gram négatifs de la famille des Sphingobacteriaceae, dont il est le genre type. C'est également le genre type de l'ordre des Sphingobacteriales et de la classe des Sphingobacteriia.

Historique

Le genre Sphingobacterium a été créé en 1983 par la microbiologiste japonaise Eiko Yabuuchi (d) et son équipe (Takichi Kaneko, Ikuya Yano, C. Wayne Moss et Noriko Miyoshi) avec comme espèce type Sphingobacterium spiritivorum. Il comprend un certain nombre d'espèces auparavant classées dans le genre Flavobacterium.

Taxonomie

Étymologie

L'étymologie du genre Sphingobacterium est la suivante : Sphin.go.bac.te.ri.um. N.L. neut. n. sphingosinum, sphingosine; du Gr. fem. n. sphinx (gen. sphingos), du sphinx; de Chem. fem. suff. -ine; N.L. pref. sphingo-, se rapportant à la sphingosine; N.L. neut. n. bacterium, un bâtonnet et en biologie, une bactérie; N.L. neut. n. Sphingobacterium, une bactérie contenant de la sphingosine.

Liste d'espèces

Selon LPSN (18 février 2023) :

Sphingobacterium alimentarium Schmidt et al. 2012
Sphingobacterium alkalisoli Xu et al. 2017
Sphingobacterium anhuiense Wei et al. 2008
Sphingobacterium arenae Jiang et al. 2014
Sphingobacterium athyrii Cheng et al. 2019
Sphingobacterium bambusae Duan et al. 2010
Sphingobacterium bovisgrunnientis Kaur et al. 2018
Sphingobacterium bovistauri Wang et al. 2022
Sphingobacterium caeni Sun et al. 2013
Sphingobacterium canadense Mehnaz et al. 2008
Sphingobacterium cavernae Zhou et al. 2020
Sphingobacterium cellulitidis Huys et al. 2017
Sphingobacterium changzhouense Liu et al. 2013
Sphingobacterium chungjuense Song et al. 2020
Sphingobacterium chuzhouense Wang et al. 2016
Sphingobacterium cibi Lai et al. 2016
Sphingobacterium cladoniae Lee et al. 2013
Sphingobacterium composti Ten et al. 2007
Sphingobacterium corticibacter Li et al. 2019
Sphingobacterium corticibacterium Li et al. 2020
Sphingobacterium corticis Li et al. 2017
Sphingobacterium daejeonense Kim et al. 2006
Sphingobacterium detergens Marqués et al. 2012
Sphingobacterium endophyticum Liu et al. 2021
Sphingobacterium faecale Chen et al. 2022
Sphingobacterium faecium Takeuchi & Yokota 1993
Sphingobacterium ginsenosidimutans Son et al. 2014
Sphingobacterium gobiense Zhao et al. 2014
Sphingobacterium griseoflavum Long et al. 2016
Sphingobacterium haloxyli Liu et al. 2018
Sphingobacterium hotanense Xiao et al. 2013
Sphingobacterium humi Lee et al. 2017
Sphingobacterium hungaricum Tóth et al. 2021
Sphingobacterium jejuense Siddiqi et al. 2016
Sphingobacterium kitahiroshimense Matsuyama et al. 2008
Sphingobacterium kyonggiense Choi & Lee 2012
Sphingobacterium lactis Schmidt et al. 2012
Sphingobacterium litopenaei Zhang et al. 2021
Sphingobacterium lumbrici Zhang et al. 2021
Sphingobacterium micropteri Zhang et al. 2021
Sphingobacterium mizutaii corrig. Yabuuchi et al. 1983
Sphingobacterium mucilaginosum Du et al. 2015
Sphingobacterium multivorum (Holmes et al. 1981) Yabuuchi et al. 1983
Sphingobacterium nematocida Liu et al. 2012
Sphingobacterium olei Liu et al. 2020
Sphingobacterium pakistanense Ahmed et al. 2015
Sphingobacterium paludis Feng et al. 2014
Sphingobacterium pedocola Tóth et al. 2022
Sphingobacterium phlebotomi Kakumanu et al. 2021
Sphingobacterium populi Li et al. 2016
Sphingobacterium praediipecoris Le et al. 2019
Sphingobacterium prati Besaury et al. 2021
Sphingobacterium psychroaquaticum Albert et al. 2013
Sphingobacterium puteale He et al. 2019
Sphingobacterium rhinopitheci Han et al. 2022
Sphingobacterium shayense He et al. 2010
Sphingobacterium siyangense Liu et al. 2008
Sphingobacterium solani Niu et al. 2018
Sphingobacterium soli Fu et al. 2017
Sphingobacterium spiritivorum (Holmes et al. 1982) Yabuuchi et al. 1983 – espèce type
Sphingobacterium suaedae Sun et al. 2015
Sphingobacterium tabacisoli Zhou et al. 2017
Sphingobacterium terrae Chaudhary & Kim 2018
Sphingobacterium thalpophilum (Holmes et al. 1983) Takeuchi & Yokota 1993
Sphingobacterium thermophilum Yabe et al. 2013
Sphingobacterium wenxiniae Zhang et al. 2012
Sphingobacterium yanglingense Peng et al. 2014
Sphingobacterium zeae Kämpfer et al. 2016

Espèces non valides

Selon LPSN (18 février 2023), les espèces suivantes n'ont pas été publiées de manière valide :

Candidatus comitans Jacobi et al. 1996. Cet genre a été publié mais de manière non valide et sans proposer formellement le nom d'espèce Sphingobacterim comitans
Sphingobacterium deserti Teng et al., 2015
Sphingobacterium paramultivorum Wang et al., 2021
Sphingobacterium paucimobilis White & Suttle 2013
Sphingobacterium rhinocerotis Li et al. 2015
Candidatus Sphingobacterium stercorigallinarum Gilroy et al. 2021
Candidatus Sphingobacterium stercoripullorum Gilroy et al. 2021
Sphingobacterium versatilis Yabuuchi et al. 1981
Sphingobacterium yamdrokense Xiao et al. 2015

Anciennes espèces

Selon LPSN (18 février 2023), les espèces suivantes ne font plus partie du genre Sophingobacterium :

Sphingobacterium antarcticus Shivaji et al. 1992 contenant une erreur de latinisation du nom a été renommée Sphingobacterium antarcticum corrig. Shivaji et al. 1992 puis est devenue l'espèce Pedobacter antarcticus (Shivaji et al. 1992) Farfán et al. 2014.
Sphingobacterium heparinum (Payza and Korn 1956) Takeuchi and Yokota 1993 est devenue l'espèce Pedobacter heparinus (Payza and Korn 1956) Steyn et al. 1998.
Sphingobacterium piscium Takeuchi and Yokota 1993 a été renommée Pedobacter antarcticus.

Noms corrigés

Sphingobacterium antarcticus Shivaji et al. 1992 contenant une erreur de latinisation du nom a été renommée Sphingobacterium antarcticum
L'espèce Sphingobacterium mizutae Yabuuchi et al. 1983 a vu son nom corrigé en Sphingobacterium mizutaii corrig. Yabuuchi et al. 1983.
L'espèce Sphingobacterium pakistanensis Ahmed et al. 2014 publiée de manière non valide et comportant un nom avec erreur a été renommée et publiée de manière valide sous le nom de Sphingobacterium pakistanense.

Publication originale

(en) Eiko Yabuuchi, Takichi Kaneko, Ikuya Yano, C. Wayne Moss et Noriko Miyoshi, « Sphingobacterium gen. nov., Sphingobacterium spiritivorum comb. nov., Sphingobacterium multivorum comb. nov., Sphingobacterium mizutae sp. nov., and Flavobacterium indologenes sp. nov.: Glucose-Nonfermenting Gram-Negative Rods in CDC Groups IIK-2 and IIb », International Journal of Systematic Bacteriology, vol. 33, n^o 3,‎ 1^er juillet 1983, p. 580–598 (ISSN 0020-7713, 1465-2102 et 1070-6259, DOI 10.1099/00207713-33-3-580, lire en ligne).

Notes et références

↑ NCBI, consulté le 6 novembre 2022.
1 2 Yabuuchi et al. 1983, p. 592
↑ Steinberg et Burg 2015.
↑ (en) « Genus Sphingobacterium », sur LPSN, 18 février 2023
1 2 3 List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 18 février 2023.
↑ (en) « Genus "Candidatus Comitans" », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature, 18 février 2023
↑ (en) « Species Sphingobacterium antarcticum », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature, 18 février 2023

Bibliographie

(en) James P. Steinberg et Eileen M. Burd, Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, vol. 2, 8, 2015 (DOI 10.1016/B978-1-4557-4801-3.00238-1), « 238 - Other Gram-Negative and Gram-Variable Bacilli - Sphingobacterium species », p. 2667-2683

Liens externes

Sur les autres projets Wikimedia :

Sphingobacterium, sur Wikimedia Commons
Sphingobacterium, sur Wikispecies

(en) NCBI : Sphingobacterium Yabuuchi et al., 1983 (taxons inclus) (consulté le 6 novembre 2022)
(en) Tree of Life Web Project : Sphingobacterium (consulté le 6 novembre 2022)

Portail de la microbiologie

[NCBI6_novembre_2022-1] NCBI, consulté le 6 novembre 2022.

[Yabuuchi_1983-2] 1 2 Yabuuchi et al. 1983, p. 592

[SteinbergBurg2015-3] Steinberg et Burg 2015.

[LPSNSphiago-4] (en) « Genus Sphingobacterium », sur LPSN, 18 février 2023

[LPSN18_février_2023-5] 1 2 3 List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 18 février 2023.

[6] (en) « Genus "Candidatus Comitans" », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature, 18 février 2023

[Sphingantar-7] (en) « Species Sphingobacterium antarcticum », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature, 18 février 2023