Son nom d'espèce, composé de mucuj[ê] et du suffixe latin-ensis, «qui vit dans, qui habite», lui a été donné en référence au lieu de sa découverte Mucugê ou Mucujê.
Publication originale
Rodrigues, 1987: Sistematica, ecologia e zoogeografia dos Tropidurus do grupo torquatus ao sul do Rio Amazonas (Sauria, Iguanidae). Arquivos De Zoologia (Sao Paulo), vol.31, n. 3, p.105-230.