Filamoeba

Filamoeba
Rendszertani besorolás
Domén: Eukarióták (Eukaryota)
Csoport: Amoebozoa
Csoport: Conosa
Csoport: Variosea
Nemzetség: Filamoeba
Page 1967
Fajok
Hivatkozások
A Wikifajok tartalmaz Filamoeba témájú rendszertani információt.

A Filamoeba az Amoebozoa Variosea kládjának nemzetsége. 1967-ben írta le Page, 1976-ban az Echinamoebidae csoportba sorolta, Adl et al. 2019-es rendszertanában ribocsoportként szerepel közvetlenül a Varioseában, nem az Echinamoebidaeben.

Történet

A nemzetséget először Page írta le 1967-ben fény- és nem közölt transzmissziós elektronmikroszkópos felvételek alapján, de 1976-ban határozta csak meg rendszertani helyzetét, ekkor az Echinamoebidaebe sorolta. 2005-ig monotipikus csoport volt, egyetlen ismert faja a Filamoeba nolandi volt.

Amaral Zettler et al. 2000-ben távolság- és valószínűség-alapú módszerek alapján a Gephyramoeba testvérnemzetségeként írta le alacsony valószínűséggel, de a Leptomyxida felülvizsgálata alapján az eredetileg „Gephyramoeba sp.”-nak nevezett fajról 2008-ban igazolták Szmirnov et al., hogy az akkor leírt Acramoeba dendroida faj.

2003-ban Thomas Cavalier-Smith a Mycetozoa Variosea csoportjába sorolta, 2005-ben az Acanthamoebae csoportba is sorolták, 2009-ben az alacsony támogatottságú Eumycetozoa sensu Spiegel csoportba sorolták Shadwick et al. Lahr et al. 2011-ben az Arachnula és Flamella nemzetségekkel együtt a Gracilipodida csoportba sorolták.

2015-ben Cavalier-Smith et al. a Varioseán belül a Varipodida tagjaként írták le, és annak Flamella nemzetséggel való egyesítésére létrehozták a Filamoebidae csoportot, ezt például az Acramoebával egyesítették a Varipodidában. Adl et al. 2019-es rendszertanában e csoport már nincs jelen, a Filamoeba ribocsoport az Evosea Variosea csoportjában utóbbi és a Filamoeba közti csoportok nélkül.

Morfológia

Legyező, háromszög vagy félhold alakú mozgó állapotú lapos amőbákból állóként írja le, melyek állábai számos tüske alakú üvegszerű alállábbal rendelkeznek, és szabálytalanul ágaznak el. Centroszóma nincs benne. Anderson és Rogerson amőbamorfológiai besorolása szerint 1. típusú. Mozgáskor elöl vékony hialoplazmája van, alállábai vékonyak és fonalasak. Mitokondriális cristái csőszerűek, párhuzamosak, sose ágaznak el vagy képeznek anasztomózist. Trofozoitái általában egymagvúak.

A Filamoeba sinensis cisztái vastag, pórus nélküli és homogén falúak, trofozoitái állábai a F. nolanditól erőben és többfelé való elágazásukban különböznek.

Ökológia

Szabadon élő bakterivor amőba, de több faj hordozhat Legionella- és Rheinheimera-fajokat.

Kráter- és hévizekben is megtalálható, vagyis egyes fajai termotoleránsak. Megtalálható ezenkívül kontaktlencse-viselők fürdőszobái és konyhái vízkövében, vagyis a kontaktlencse-tisztaság egyik indikátora. Sivatagi bokrokban az egyik leggyakoribb szabadon élő amőbafaj.

A Filamoeba sinensis a Carassius gibelio kopoltyúiban és szabadon egyaránt élhet, továbbá kimutatták házisertés-béltartalomban is, vagyis amfizoikus.

Életciklus

Életciklusában nem ismert ostoros állapot, és termőtestet se képez. Cisztát képezhet, ekkor sejtfala 1 rétegű.

Genetika

VPS9-, GAP9-, RABEX5-, több V9DCP-, alzin- és VARP-homológja és 2 ezekkel rokon ismeretlen fehérjéje van. A Filamoeba nolandi 18S rRNS-e teljesen szekvenált, 2000. december 2-án lett elérhető AF293896 azonosítóval.

Nincs II-es típusú, van viszont I-es típusú zsírsavszintáza, ostoros szakasza hiányát Cavalier-Smith et al. 2015-ben az ostor nélküli Conosa-fajokhoz hasonlóan másodlagos veszteséggel magyarázták.

Filogenetika

A Filamoeba egy 2015-ös elemzés szerint a Phalansterium testvércsoportja, a két csoport együttese a Stygamoeba testvércsoportján belül bazális, és hosszú ággal rendelkezik.

Jegyzetek

  1. 1 2 3 4 5 6 Adl SM, Bass D, Lane CE, Lukeš J, Schoch CL, Smirnov A, Agatha S, Berney C, Brown MW, Burki F, Cárdenas P, Čepička I, Chistyakova L, Del Campo J, Dunthorn M, Edvardsen B, Eglit Y, Guillou L, Hampl V, Heiss AA, Hoppenrath M, James TY, Karnkowska A, Karpov S, Kim E, Kolisko M, Kudryavtsev A, Lahr DJG, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, Mann DG, Massana R, Mitchell EAD, Morrow C, Park JS, Pawlowski JW, Powell MJ, Richter DJ, Rueckert S, Shadwick L, Shimano S, Spiegel FW, Torruella G, Youssef N, Zlatogursky V, Zhang Q (2019. január 19.). "Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes". J Eukaryot Microbiol. 66 (1): 4–119. doi:10.1111/jeu.12691. PMC 6492006. PMID 30257078.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  2. 1 2 3 4 5 6 Dyková I, Pecková H, Fiala I, Dvořáková H (2005). "Filamoeba sinensis sp. n., a second species of the genus Filamoeba Page, 1967, isolated from gills of Carassius gibelio (Bloch, 1782)". Acta Protozool. 44: 75–80.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  3. ↑ Smirnov AV, Nassonova ES, Cavalier-Smith T (2008. február 22.). "Correct identification of species makes the amoebozoan rRNA tree congruent with morphology for the order Leptomyxida Page 1987; with description of Acramoeba dendroida n. g., n. sp., originally misidentified as 'Gephyramoeba sp.'". Eur J Protistol. 44 (1): 35–44. doi:10.1016/j.ejop.2007.08.001. PMID 17905574.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  4. ↑ Cavalier-Smith T (2004. június 22.). "Only six kingdoms of life". Proc Biol Sci. 271 (1545): 1251–1262. doi:10.1098/rspb.2004.2705. PMC 1691724. PMID 15306349.
  5. ↑ Marquez SM, Harris JK, Kelley ST, Brown JW, Dawson SC, Roberts EC, Pace NR (2005. április 5.). "Structural implications of novel diversity in eucaryal RNase P RNA". RNA. 11 (5): 739–751. doi:10.1261/rna.7211705. PMC 1370759. PMID 15811915.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  6. 1 2 Shadwick LL, Spiegel FW, Shadwick JD, Brown MW, Silberman JD (2009. augusztus 25.). "Eumycetozoa = Amoebozoa?: SSUrDNA phylogeny of protosteloid slime molds and its significance for the amoebozoan supergroup". PLoS One. 4 (8). doi:10.1371/journal.pone.0006754. PMC 2727795. PMID 19707546. {{cite journal}}: More than one of |number= és |issue= specified (súgó)CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  7. 1 2 3 Adl SM, Simpson AG, Lane CE, Lukeš J, Bass D, Bowser SS, Brown MW, Burki F, Dunthorn M, Hampl V, Heiss A, Hoppenrath M, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, McManus H, Mitchell EAD, Mozley-Stanridge SE, Parfrey LW, Pawlowski J, Rueckert S, Shadwick L, Shadwick L, Schoch CL, Smirnov A, Spiegel FW (2012. szeptember 28.). "The revised classification of eukaryotes". J Eukaryot Microbiol. 59 (5): 429–493. doi:10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. PMC 3483872. PMID 23020233.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  8. 1 2 Cavalier-Smith T, Fiore-Donno AM, Chao EEY, Kudryavtsev A, Berney C, Snell EA, Lewis R. "Multigene phylogeny resolves deep branching of Amoebozoa". Mol Phylogenet Evol. 83: 293–304. Hozzáférés: 2024. december 15.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  9. ↑ Rodriguez-Zaragoza S, Mayzlish E, Steinberger Y (2005. április 1.). "Vertical distribution of the free-living amoeba population in soil under desert shrubs in the Negev desert, Israel". Appl Environ Microbiol. 71 (4): 2053–2060. doi:10.1128/AEM.71.4.2053-2060.2005. PMC 1082504. PMID 15812038.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  10. ↑ Lahr DJG, Grant J, Nguyen T, Lin JH, Katz LA (2011. július 28.). "Comprehensive phylogenetic reconstruction of amoebozoa based on concatenated analyses of SSU-rDNA and actin genes". PLoS One. 6 (7). doi:10.1371/journal.pone.0022780. PMC 3145751. PMID 21829512. {{cite journal}}: More than one of |number= és |issue= specified (súgó)CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  11. ↑ Ceja-Navarro JA, Wang Y, Ning D, Arellano A, Ramanculova L, Yuan MM, Byer A, Craven KD, Saha MC, Brodie EL, Pett-Ridge J, Firestone MK (2021. április 28.). "Protist diversity and community complexity in the rhizosphere of switchgrass are dynamic as plants develop". 9 (96). doi:10.1186/s40168-021-01042-9. PMC 8082632. PMID 33910643. {{cite journal}}: Cite journal requires |journal= (súgó); Unknown parameter |journa= ignored (súgó)CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  12. ↑ Gast RJ, Moran DM, Dennett MR, Wurtsbaugh WA, Amaral-Zettler LA (2011. február 3.). "Amoebae and Legionella pneumophila in saline environments". J Water Health. 9 (1): 37–52. doi:10.2166/wh.2010.103. PMC 3109871. PMID 21301113. Hozzáférés: 2024. december 15.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  13. ↑ Salazar-Ardiles C, Asserella-Rebollo L, Andrade DC (2022. október 18.). "Free-living amoebas in extreme environments: The true survival in our planet". Biomed Res Int. 2022 (2359883). doi:10.1155/2022/2359883. PMC 9596261. PMID 36303587.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  14. ↑ Seal D, Stapleton F, Dart J (1992. július 1.). "Possible environmental sources of Acanthamoeba spp in contact lens wearers" (PDF). Br J Ophthalmol. 76 (7): 424–427. doi:10.1136/bjo.76.7.424. PMC 504304. PMID 1627513. Hozzáférés: 2024. december 15.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  15. 1 2 Chavatte N, Lambrecht E, van Damme I, Sabbe K, Houf K (2016. július 30.). "Free-living protozoa in the gastrointestinal tract and feces of pigs: Exploration of an unknown world and towards a protocol for the recovery of free-living protozoa". Vet Parasitol. 225: 91–98. doi:10.1016/j.vetpar.2016.06.002. PMID 27369581.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  16. ↑ Herman EK, Ali M, Field MC, Dacks JB (2018. április 25.). "Regulation of early endosomes across eukaryotes: Evolution and functional homology of Vps9 proteins". Traffic. 19 (7): 546–563. doi:10.1111/tra.12570. PMC 6032885. PMID 29603841.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  17. ↑ Amalar Zettler LA, Nerad TA, O'Kelly CJ, Peglar MT, Gillevet PM, Silberman JD, Sogin ML. "Filamoeba nolandi small subunit ribosomal RNA gene, complete sequence".{{cite web}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  18. ↑ Kohli GS, John U, Van Dolah FM, Murray SA (2016. január 19.). "Evolutionary distinctiveness of fatty acid and polyketide synthesis in eukaryotes". ISME J. 10 (8): 1877–1890. doi:10.1038/ismej.2015.263. PMC 5029157. PMID 26784357.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  19. ↑ Lahr DJG, Grant J, Molestina R, Katz LA, Anderson OR (2015. január 6.). "Sapocribrum chincoteaguense n. gen. n. sp.: A small, scale-bearing amoebozoan with flabellinid affinities". J Eukaryot Microbiol. 62 (4): 444–453. doi:10.1111/jeu.12199. PMC 4469638. PMID 25515047.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)

További információk