Halobacteria

Halobacteria
	Halobacterium
Rendszertani besorolás
Domén:	Archaea;
Ország:	Archaea;
Törzs:	Euryarchaeota;
Osztály:	Halobacteria;
Szinonimák
	Halobacteria Grant et al. 2002;
Rend
	Halobacteriales;
Hivatkozások
	A Wikifajok tartalmaz Halobacteria témájú rendszertani információt. A Wikimédia Commons tartalmaz Halobacteria témájú kategóriát.

A Halobacteria egy Euryarchaeota törzsbe tartozó archea osztály. Sóval telített vagy majdnem telített vízben élnek.

Az osztály tagjai magas sókoncentráció mellett növekednek. A Halobacteria az archeák elkülönült evolúciós ágát alkotja, és általában extremofileknek tekintik a tagjait, bár nem minden tagját lehet annak tekinteni. Nőhetnek aerob és anaerob módon is. A membránjuk egyes részei lilás színűek. Rendelkeznek bakteriorodopszinnal, amit fény elnyelésére használnak, ez pedig energiát szolgáltat az ATP előállításához.

Törzsfejlődés

Az extrém halofil aerob archeákat a euryarchaeota törzsbe, azon belül a Halobacteria osztályba, azon belül a Halobacteriales rendbe, azon belül a Halobacteriaceae családba sorolják, aminek 2015 májusában 48 nemzetsége és 191 faja ismert.

Domén: Archaea

Törzs: Euryarchaeota

Osztály: Halobacteria
- Rend: Halobacteriales
  - Család: Halobacteriaceae
    - Haladaptatus [Hap.]
      - Haladaptatus cibarius
      - Haladaptatus litoreus
      - Haladaptatus pallidirubidus
      - Haladaptatus paucihalophilus (típusfaj)
    - Halalkalicoccus [Hac.]
      - Halalkalicoccus jeotgali
      - Halalkalicoccus tibetensis (típusfaj)
      - Halalkalicoccus paucihalophilus
    - Halapricum [Hpr.]
      - Halapricum salinum (típusfaj)
    - Halarchaeum [Hla.]
      - Halarchaeum acidiphilum (típusfaj)
      - Halarchaeum nitratireducens
      - Halarchaeum rubridurum
      - Halarchaeum salinam
      - Halarchaeum solikamskense
    - Haloarchaeobius [Hab.]
      - Haloarchaeobius iranensis (típusfaj)
      - "Haloarchaeobius litoreus" (Antonie Van Leeuwenhoek, 2014, 105(6):1085-1090)
    - Haloarcula [Har.]
      - Haloarcula amylolytica
      - Haloarcula argentinensis
      - Haloarcula hispanica
      - Haloarcula japonica
      - Haloarcula marismortui
      - Haloarcula quadrata
      - Haloarcula salaria
      - Haloarcula tradensis
      - Haloarcula vallismortis (típusfaj)
    - Halobacterium [Hbt.] (típusnem)
      - Halobacterium jilantaiense
      - Halobacterium noricense
      - "Halobacterium piscisalsi" (szubjektív szinonímája a Halobacterium salinarumnak)
      - "Halobacterium ruburm" (Arch Microbiol, 2014, in press)
      - Halobacterium salinarum (típusfaj)
    - Halobaculum [Hbl.]
      - Halobaculum gomorrense (típusfaj)
      - Halobaculum magnesiiphilum
    - Halobellus [Hbs.]
      - Halobellus clavatus (típusfaj)
      - Halobellus inordinatus
      - Halobellus limi
      - Halobellus litoreus
      - Halobellus salinus
      - Halobellus rarus
      - Halobellus rufus
    - Halobiforma [Hbf.]
      - Halobiforma haloterrestris (típusfaj)
      - Halobiforma lacisalsi
      - Halobiforma nitratireducens
    - Halococcus [Hcc.]
      - Halococcus dombrowskii
      - Halococcus hamelinensis
      - Halococcus morrhuae (típusfaj)
      - Halococcus qingdaonensis
      - Halococcus saccharolyticus
      - Halococcus salifodinae
      - Halococcus sediminicola
      - Halococcus thailandensis
    - Haloferax [Hfx.]
      - Haloferax alexandrinus
      - Haloferax chudinovii
      - Haloferax denitrificans
      - Haloferax elongans
      - Haloferax gibbonsii
      - Haloferax larsenii
      - Haloferax lucentense
      - Haloferax mediterranei
      - Haloferax mucosum
      - Haloferax prahovense
      - Haloferax sulfurifontis
      - Haloferax volcanii (típusfaj)
    - Halogeometricum [Hgm.]
      - Halogeometricum borinquense (típusfaj)
      - Halogeometricum limi
      - Halogeometricum pallidum
      - Halogeometricum rufum
    - Halogranum [Hgn.]
      - Halogranum amylolyticum
      - Halogranum gelatinilyticum
      - Halogranum rubrum (típusfaj)
      - Halogranum salarium
    - Halohasta [Hht.]
      - Halohasta litorea (típusfaj)
      - Halohasta litchfieldiae
    - Halolamina [Hlm.]
      - Halolamina pelagica (típusfaj)
      - Halolamina rubra
      - Halolamina salifodinae
      - Halolamina salina
    - Halomarina [Hmr.]
      - Halomarina oriensis (típusfaj)
    - Halomicroarcula [Hma.]
      - Halomicroarcula limicola
      - Halomicroarcula pellucida (típusfaj)
    - Halomicrobium [Hmc.]
      - Halomicrobium katesii
      - Halomicrobium mukohataei (típusfaj)
      - Halomicrobium zhouii
    - Halonotius [Hns.]
      - Halonotius pteroides (típusfaj)
    - Halopelagius [Hpl.]
      - Halopelagius inordinatus (típusfaj)
      - Halopelagius fulvigenes
      - Halopelagius longus
    - Halopenitus [Hpt.]
      - "Halopenitus salinus"
      - Halopenitus malekzadehii
      - Halopenitus persicus (típusfaj)
    - Halopiger [Hpg.]
      - Halopiger aswanensis
      - Halopiger salifodinae
      - Halopiger xanaduensis (típusfaj)
    - Haloplanus [Hpn.]
      - Haloplanus aerogenes
      - Haloplanus litoreus
      - Haloplanus natans (típusfaj)
      - Haloplanus ruber
      - Haloplanus salinus
      - Haloplanus vescus
    - Haloquadratum [Hqr.]
      - Haloquadratum walsbyi (típusfaj)
    - Halorhabdus [Hrd.]
      - Halorhabdus tiamatea
      - Halorhabdus utahensis (típusfaj)
    - Halorientalis [Hos.]
      - Halorientalis persicus
      - Halorientalis regularis (típusfaj)
    - Halorubellus [Hrb.]
      - Halorubellus litoreus
      - Halorubellus salinus (típusfaj)
    - Halorubrum [Hrr.]
      - Halorubrum aquaticum
      - Halorubrum aidingense
      - Halorubrum alkaliphilum
      - Halorubrum arcis
      - Halorubrum californiense
      - Halorubrum chaoviator
      - Halorubrum cibi
      - Halorubrum coriense
      - Halorubrum distributum
      - Halorubrum ejinorense
      - Halorubrum ezzemoulense
      - Halorubrum halophilum
      - Halorubrum lacusprofundi
      - Halorubrum lipolyticum
      - Halorubrum litoreum
      - Halorubrum luteum
      - Halorubrum orientale
      - Halorubrum rubrum
      - Halorubrum saccharovorum (típusfaj)
      - "Halorubrum salinum" (Arch Microbiol, 2014, 196(6):395-400.)
      - Halorubrum sodomense
      - Halorubrum tebenquichense
      - Halorubrum terrestre
      - Halorubrum tibetense
      - Halorubrum trapanicum
      - Halorubrum vacuolatum
      - Halorubrum xinjiangense
    - Halorussus [Hrs.]
      - Halorussus rarus
    - Halosimplex [Hsx.]
      - Halosimplex carlsbadense (típusfaj)
      - Halosimplex pelagicum
      - Halosimplex rubrum
    - Halostagnicola [Hst.]
      - Halostagnicola alkaliphila
      - Halostagnicola bangensis
      - Halostagnicola kamekurae
      - Halostagnicola larsenii (típusfaj)
    - Haloterrigena [Htg.]
      - Haloterrigena daqingensis
      - Haloterrigena hispanica
      - Haloterrigena jeotgali
      - Haloterrigena limicola
      - Haloterrigena longa
      - Haloterrigena saccharevitans
      - Haloterrigena salina
      - Haloterrigena thermotolerans
      - Haloterrigena turkmenica (típusfaj)
    - Halovenus [Hvn.]
      - Halovenus aranensis (típusfaj)
    - Halovivax [Hvx.]
      - Halovivax asiaticus (típusfaj)
      - "Halovivax limisalsi"
      - Halovivax ruber
    - Natrialba [Nab.]
      - Natrialba aegyptia
      - Natrialba asiatica (típusfaj)
      - Natrialba chahannaoensis
      - Natrialba hulunbeirensis
      - Natrialba magadii
      - Natrialba taiwanensis
    - Natrinema [Nnm.]
      - Natrinema altunense
      - Natrinema ejinorense
      - Natrinema gari
      - Natrinema pallidum
      - Natrinema pellirubrum (típusfaj)
      - Natrinema salaciae
      - Natrinema versiforme
    - Natronoarchaeum [Nac.]
      - Natronoarchaeum mannanilyticum (típusfaj)
      - Natronoarchaeum philippinense
      - Natronoarchaeum rubrum
    - Natronobacterium [Nbt.]
      - Natronobacterium gregoryi (típusfaj)
      - Natronobacterium texcoconense
    - Natronococcus [Ncc.]
      - Natronococcus amylolyticus
      - Natronococcus jeotgali
      - Natronococcus occultus (típusfaj)
      - Natronococcus roseus
    - Natronolimnobius [Nln.]
      - Natronolimnobius baerhuensis (típusfaj)
      - Natronolimnobius innermongolicus
    - Natronomonas [Nmn.]
      - Natronomonas gomsonensis
      - Natronomonas moolapensis
      - Natronomonas pharaonis (típusfaj)
    - Natronorubrum [Nrr.]
      - Natronorubrum aibiense
      - Natronorubrum bangense (típusfaj)
      - Natronorubrum sediminis
      - Natronorubrum sulfidifaciens
      - Natronorubrum texcoconense
      - Natronorubrum tibetense
    - Salarchaeum [Sar.]
      - Salarchaeum japonicum (típusfaj)
    - Salinarchaeum [Saa.]
      - Salinarchaeum laminariae (típusfaj)
    - Salinigranum [Sgn.]
      - Salinigranum rubrum (típusfaj)
    - "Salinirubrum" ["Srr".]
      - "Salinirubrum litoreum" (típusfaj) (Antonie Van Leeuwenhoek, 105:135-141)

Leírásuk

A növekedésükhöz sót igényelnek 2M vagy körülbelül 10%-os koncentrációban, az optimális növekedés általában sokkal magasabb koncentrációnál (tipikusan 20-25%) következik be. Azonban képesek nőni magasabb telítettségnél is, körülbelül 37%-os koncentrációnál.

Főleg hipersós tavakban élnek. A nagy sűrűségük gyakran vezet a víz rózsaszín vagy piros elszíneződéséhez (a sejtek magas szintű karotinoid pigmentekkel rendelkeznek, feltehetően az UV-sugárzás elleni védelem miatt).

Rendelkeznek bakteriorodopszinnal, amit fény elnyelésére használnak, így energiához jutva az ATP előállításához. Másik pigmentje a halorodopszin, ami kloridionokat pumpál, előállítva egy feszültséggradienst, és ezzel elősegítve a fényből való energiatermelést. A folyamat nem áll kapcsolatban az elektrontranszportot magába foglaló fotoszintézis más formáival, és a halobacteria képtelen szenet megkötni szén-dioxidból.

Gyakran tekintik pleomorfnak a tagjait, mert többféle alakot is felvehetnek, még egyetlen fajon belül is. Emiatt a mikroszkopikus eszközökkel való azonosításuk nehéz, és jelenleg helyette sokkal gyakrabban génszekvenálással azonosítják őket.

Egy rendkívül szokatlan alakú Halobacteria a Haloquadratum walsbyi. Négyzet alakú és extrém vékony, mint egy postabélyeg. Ez az alakja valószínűleg csak a víz magas ozmotikus koncentrációja mellett létezik.

A marsi légkör nyomása a víz hármaspontja alatt van, ezért édesvízi fajoknak nem lenne élőhelye a Mars felszínén, azonban felvetették, hogy a halobaktériumok talán kivételt képeznek, és még így is megélnének a bolygón.

Jegyzetek

↑ See the NCBI webpage on Halobacteria. Data extracted from the "NCBI taxonomy resources". Biotechnológiai Információk Nemzeti Központja. Hozzáférés: 2007. március 19.
↑ Minegishi, H., Echigo, A., Shimane, Y., Kamekura, M., Tanasupawat, S., Visessanguan, W., Usami, R. (2012) "Halobacterium piscisalsi Yachai et al. 2008 is later heterotypic synonym of Halobacterium salinarum Elazari-Volcani 1957." Int J Syst Evol Microbiol. 62: 2160-2162
↑ Qiu, X.X., Zhao, M.L., Han, D., Zhang, W.J., Dyall-Smith, M.L., Cui, H.L. (2013) "Taxonomic study of the genera Halogeometricum and Halosarcina: transfer of Halosarcina limi and Halosarcina pallida to the genus Halogeometricum as Halogeometricum limi comb. nov. and Halogeometricum pallidum comb. nov., respectively." Int J Syst Evol Microbiol. 63: 3915-3919
↑ DasSarma, Shiladitya (2007). "Extreme Microbes". American Scientist. 95 (3): 224–231. doi:10.1511/2007.65.1024. ISSN 0003-0996.
↑ This paragraph taken directly from the Academic Dictionaries and Encyclopedias page on Halobacterium
↑ DasSarma, Shiladitya. "Extreme Halophiles Are Models for Astrobiology" (PDF). 2007. február 2. dátummal az eredeti (PDF) címről archiválva. Hozzáférés: 2007. március 17.

Biológiaportál • összefoglaló, színes tartalomajánló lap

[1] See the NCBI webpage on Halobacteria. Data extracted from the "NCBI taxonomy resources". Biotechnológiai Információk Nemzeti Központja. Hozzáférés: 2007. március 19.

[2] Minegishi, H., Echigo, A., Shimane, Y., Kamekura, M., Tanasupawat, S., Visessanguan, W., Usami, R. (2012) "Halobacterium piscisalsi Yachai et al. 2008 is later heterotypic synonym of Halobacterium salinarum Elazari-Volcani 1957." Int J Syst Evol Microbiol. 62: 2160-2162

[3] Qiu, X.X., Zhao, M.L., Han, D., Zhang, W.J., Dyall-Smith, M.L., Cui, H.L. (2013) "Taxonomic study of the genera Halogeometricum and Halosarcina: transfer of Halosarcina limi and Halosarcina pallida to the genus Halogeometricum as Halogeometricum limi comb. nov. and Halogeometricum pallidum comb. nov., respectively." Int J Syst Evol Microbiol. 63: 3915-3919

[4] DasSarma, Shiladitya (2007). "Extreme Microbes". American Scientist. 95 (3): 224–231. doi:10.1511/2007.65.1024. ISSN 0003-0996.

[5] This paragraph taken directly from the Academic Dictionaries and Encyclopedias page on Halobacterium

[6] DasSarma, Shiladitya. "Extreme Halophiles Are Models for Astrobiology" (PDF). 2007. február 2. dátummal az eredeti (PDF) címről archiválva. Hozzáférés: 2007. március 17.