Jakoba

Jakoba
4 Jakobida-faj: Jakoba libera (ventrális), Stygiella incarcerata (ventrális), Reclinomonas americana (dorzális), Histiona aroides (ventrális)
4 Jakobida-faj: Jakoba libera (ventrális), Stygiella incarcerata (ventrális), Reclinomonas americana (dorzális), Histiona aroides (ventrális)
Rendszertani besorolás
Domén: Eukarióták (Eukaryota)
Ország: Excavata
Osztály: Jakobea
Rend: Jakobida
Család: Jakobidae
Patterson 1990
Nemzetség: Jakoba
Patterson 1990
Szinonimák
  • Cryptobia libera Ruinen 1938
Fajok
Hivatkozások
A Wikifajok tartalmaz Jakoba témájú rendszertani információt.

A Jakoba az Excavata génusza, és 1 leírt fajt tartalmaz, a David J. Patterson által 1990-ben leírt Jakoba liberát, és a holland algológus, miológus és lichenológus Jakoba Ruinenről lett elnevezve (a korábban Jakoba incarcerata nevű faj neve Andalucia incarcerata lett, a Jakoba bahamensist formálisan nem írták le).

Jakoba libera, fáziskontrasztos fénymikrográf egy típuskultúra élő sejtjéből

Megjelenése és jellemzői

A Jakoba génusz tagjai a Jakobida rend kis bakterivor ostorosai rendből tengeri és hipersós környezetekben. Kétostoros szabadon úszó, 5-10 μm hosszú sejtek. A sejtek hosszanti tengelyük mentén forognak az egyenes vonalú úszáshoz, kivéve alakváltozás esetén. Táplálkozáskor a vízoszlopból a hátulsó ostor által létrehozott vízáramlattal távolítják el a baktériumokat, így azok a sejt jobb ventrális oldalán lévő vájatban összegyűlnek, segítve a táplálék bevitelét és az azt körülvevő vakuólumok létrejöttét.

Ultraszerkezet

A Jakoba sejtalkotói nem különösen egyediek. Egy sejtmagvuk van az ostoralapokhoz közel, egy Golgi-készülékük, és a mitokondriális cristák laposak, így feltehetően más platikrisztát taxonokkal rokon. A mitokondriumok baktériumszerű genomjaik miatt keltenek jelentős érdeklődést. Kiderült, hogy a mitokondriális genomjuk sokkal több funkcionális gént tartalmaz más eukarióta csoportoknál, és a bakteriális RNS-polimerázt is megtarthatták, melyet más mitokondriummal rendelkező eukarióták esetén a virális váltott fel. A Jakobida mitokondriális genomja elsődlegesen összetett, mivel a bakteriális ősökhöz jobban hasonlít más ismert mitokondriumoknál.

Életciklus

A Jakoba ivartalanul szaporodik kettéhasadással. Nem figyeltek meg esetében ivaros szaporodást vagy cisztaképzést.

Molekuláris szekvencia

A Jakoba libera ATCC 50422 mitokondriális genomja 96,6 kbp méretű. A szekvenálás majdnem kész. 2012-ig 77 gént azonosítottak, egyikükben sincs intron. Az intergénikus régiók a genom mintegy 30%-át adják, és tandem ismétlődések csoportjait tartalmazzák, melyek egységhossza mintegy 20 bp. Mindkét DNS-szálon vannak átírt gének. A standard genetikai kód használatos transzlációra. A kódolt gének közé tartoznak a mitokondriális DNS-ben gyakran szereplők, például a nad1, 2, 3, 4, 4L, 5, 6, cob, cox1, 2, 3, atp6, 8, 9, valamint a nagy (rnl) és kis (rns) rRNS-gének, valamint több mint 22 tRNS-gén. Ezenkívül számos protisztákra jellemző, állatokra és gombákra nem jellemző gén is jelen van, ilyenek a nad7, 9, 11, az atp1, az rpl2, 5, 6, 14, 16 és az rps2-4, 11-14 és 19. Számos egyedi ORF is jelen van a J. libera mtDNS-ében. Számos mitokondriális génje ritka vagy nincs jelen más mitokondriális genomokban, de bakteriálisakban gyakori. Ilyen például a dpo, az rpoB, C, az rrn5, az rnpB, a tufA, a yejU–W, valamint számos riboszómásfehérje-gén. A génsorrend alapján a baktériumokban nem fellelhető csoportok a protomitokondrium baktériumoktól való kiválásával jelentek meg. Ilyenek például az sdh3–nad5 ötgénes csoport, az atp8-[trn]-rps4-atp9 és az nad11-nad1-cox11-cox3-tufA is.

A Jakoba libera nem rendelkezik azonban bizonyos mitokondriálisan kódolt bakteriális génekkel, például két RNS-polimeráz génje, az rpoA és az rpoD nincs benne, a Jakoba bahamensis mitokondriális genomja nem tartalmazza az rpl34 és rpl35 géneket.

Kultúrák

Jelenleg 3 kultúraképzésre elérhető Jakoba libera-törzs van. Ezek nem növekedhetnek más fajokba tartozó élőlény nélkül, de kevés hozzáadott Klebsiella aerogenes esetén már igen.

Hasonló nemzetségek

Jakobida vagy Jakobea

Malawimonas: 1 leírt faj

Retortamonada:

Carpediemonadida:

Jegyzetek

  1. ↑ Rodriquez-Ezpeleta, Naiara; Henner Brinkmann; Gertraud Burger; Andrew J. Roger; Michael W. Gray; Herve Philippe; B. Franz Lang (2007. augusztus). "Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans". Current Biology. 17 (16): 1420–1425. doi:10.1016/j.cub.2007.07.036. PMID 17689961.
  2. ↑ Simpson, A. G. B., Patterson, D. J. (2001). "On core jakobids and excavate taxa: the ultrastructure of Jakoba incarcerata". J. Euk. Microbial. 48: 480–492. doi:10.1111/j.1550-7408.2001.tb00183. {{cite journal}}: Check |doi= value (súgó)CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)x
  3. ↑ Patterson, D. J. 1990. Jakoba libera (Ruinen, 1938) a heterotrophic flagellate from deep oceanic sediments. Journal of the Marine Biological Association, U.K. 70: 381-393
  4. ↑ Burkhardt, Lotte (2022). Eine Enzyklopädie zu eponymischen Pflanzennamen [Encyclopedia of eponymic plant names] (pdf) (német nyelven). Berlin: Botanic Garden and Botanical Museum, Freie Universität Berlin. doi:10.3372/epolist2022. ISBN 978-3-946292-41-8. Hozzáférés: 2022. január 27.
  5. 1 2 "Jakoba libera". The Tree of Life Web Project. 2011. szeptember 27. dátummal az eredeti címről archiválva. Hozzáférés: 2012. április 3.
  6. 1 2 3 4 5 "Jakoba". Protist Image Database. 2006. szeptember 22. dátummal az eredeti címről archiválva. Hozzáférés: 2012. április 3.
  7. 1 2 "Jakoba libera". Encyclopedia of Life. Hozzáférés: 2012. április 3.
  8. ↑ "Jakobida". The Tree of Life Web Project. 2019. november 29. dátummal az eredeti címről archiválva. Hozzáférés: 2012. április 13.
  9. ↑ "Jakoba libera Mitochondria genome organization, gene content, genetic code". 2011. szeptember 22. dátummal az eredeti címről archiválva. Hozzáférés: 2012. április 3.
  10. 1 2 Gertraud Burger, Matthew W. Gray, Lise Forget, B. Franz Lang (2013. január 18.). "Strikingly Bacteria-Like and Gene-Rich Mitochondrial Genomes throughout Jakobid Protists". Genome Biol Evol. 5 (2): 418–438. doi:10.1093/gbe/evt008. PMC 3590771. PMID 23335123.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  11. ↑ "Introduction to the jakobid flagellates". Protist Image Database. Hozzáférés: 2012. április 12.