Fulham FC
A Fulham 2006 januárjában véglegesítette Warner szerződését, aki ezután kevés játéklehetőséghez jutott. Augusztus 4-én a Leeds United egy hónapra kölcsönvette, hogy vele pótolja a sérült Neil Sullivant. Egy nappal később, egy Norwich City ellen 1-0-ra megnyert mérkőzésen debütált. Szeptember 4-én vissza kellett volna térnie a Fulhamhez, de kölcsönszerződését 2007. január 1-jéig meghosszabbították. Majdnem minden meccsen kezdőként lépett pályára, amíg ki nem rúgták a menedzsert, Kevin Blackwellt. Az új mester, Dennis Wise új kapust vett kölcsön helyette, miután egy Southend United elleni Ligakupa-meccsen rendkívül rosszul teljesített. 2007 első napján visszatért a londoniakhoz. Visszatérése után a Norwich City a 2006/07-es idény végéig kölcsönvette. 13 bajnokin kapott lehetőséget.
2007. augusztus 10-én, egy Arsenal elleni találkozó előtt a Fulham első számú kapusa, Antti Niemi megsérült, így az utolsó pillanatban Warnernek kellett beugrania helyette. A körülmények ellenére remekül védett, de a meccs végén az Ágyúsok két gólt is szereztek, ezzel a fehér mezesek 2-1-es vereséget szenvedtek. Három nappal később, a Bolton Wanderers ellen hatalmasat hibázott, amikor kiejtette a labdát Nicky Hunt bedobása után, ezzel kihagyhatatlan helyzetbe hozva Heiðar Helgusont. Később sikerült javítania, amikor hatalmasat védett Nicolas Anelka próbálkozásánál. A Fulham 2-1 arányban győzött.
Augusztus 18-án, egy Middlesbrough elleni mérkőzésen rosszul számította ki a labda röppályáját Mido lövése után, és a játékszer a mellkasáról levágódva a kapuban kötött ki. Csakúgy, mint a Bolton ellen, ezúttal is bemutatott egy hatalmas védést, most David Wheater lövését hárította bravúrral. Ennek ellenére a Boro nyert 2-1-re. Mivel Niemi továbbra is sérült volt, Warner pedig sokat hibázott, a Fulham menedzsere, Lawrie Sanchez 2007. augusztus 23-án leigazolta Kasey Kellert. A két nappal későbbi, Aston Villa elleni találkozón Warner csak a kispadra került. Augusztus 28-án, a Shrewsbury Town ellen azonban pályára lépett és nem kapott gólt. Antti Niemi felépülése után azonban visszacsúszott a harmadik helyre a ranglétrán.
Ezután kölcsönben a másodosztályú Barnsleyhoz igazolt, ahol egy Coventry City ellen 4-0-ra elveszített meccsen mutatkozott be. 2008. május 28-án elküldte a Fulham.
