L'arcipelago dei Chonos è formato da 45 isole maggiori e da circa 1000 piccole isole, per una superficie totale di circa 12000km². Si estende da nord a sud per circa 120 miglia e con una larghezza media (est-ovest) di circa 30/40 miglia. Il profondo canale Moraleda separa l'arcipelago dalla terraferma cilena e dall'isola Magdalena (a est); a nord il golfo del Corcovado lo separa dall'arcipelago di Chiloé. A ovest si affaccia sull'oceano Pacifico. A sud dell'arcipelago si trova la penisola di Taitao.
L'unico centro abitato di tutto l'arcipelago dei Chonos è Melinka, situato sull'isola di Ascensión, nel sottogruppo dell'arcipelago Guaitecas. la cui popolazione contava 1 473 abitanti al censimento del 2012.
Numerosi sono i canali che separano le isole, i maggiori sono: Tuamapu (che separa a nord le isole Guaitecas), King, Ninualac, Darwin, Pulluche e Chacabuco.
Chaffers, ha una superficie di 185km², nella sua parte nord-ovest si trova il monte Mayne che misura 624 metri di altezza e nella sua parte orientale un altro senza nome raggiunge i 670m44°14′S 73°57′W44°14′S, 73°57′W.
Rojas, a sud di Chaffers, ha una superficie di 120km²44°22′41″S 73°58′13″W44°22′41″S, 73°58′13″W.
Teresa, a est di James, ha una superficie di 158km²44°51′29″S 73°48′51″W44°51′29″S, 73°48′51″W.
Cuptana, situata a est di Benjamin, ha una superficie di 319km²; nella sua parte centrale il cerro Cuptana, una delle cime più alte dell'arcipelago, supera i 1300 metri di altezza 44°38′05″S 73°41′46″W44°38′05″S, 73°41′46″W.
Tránsito, a sud di Cuptana, ha una superficie di 113km².
Settore meridionale:
Kent, a sud dell'imbocco occidentale del canale Ninualac 45°05′56″S 74°22′18″W45°05′56″S, 74°22′18″W.
Dring, a sud di Kent, ha una superficie di 354km²45°13′27″S 74°20′00″W45°13′27″S, 74°20′00″W.
Victoria, a sud di Melchor; ha una superficie di 191km²45°18′25″S 73°53′53″W45°18′25″S, 73°53′53″W.
Isquiliac, a sud di Dring e a ovest di Victoria, ha una superficie di 185km²45°20′40″S 74°22′13″W45°20′40″S, 74°22′13″W.
Italia, isola minore tra Isquiliac e Victoria 45°21′08″S 74°09′52″W45°21′08″S, 74°09′52″W.
Quemada, tra Victoria e Luz.
Luz, situata tra Quemada e Humos, ha una superficie di 232km²; il suo monte Vesuvio misura 731 metri d'altezza 45°29′24″S 73°56′10″W45°29′24″S, 73°56′10″W.