Gen Horiuchi (堀内 元?; Tokyo, 29 agosto 1965) è un ex ballerino giapponese, primo ballerino del New York City Ballet dal 1989 al 1994 e direttore artistico del Saint Louis Ballet dal 2000.
Figlio di ballerini classici, Gen Horiuchi nacque a Tokyo nel 1964. La vittoria del Prix de Lausanne nel 1980 gli valse una borsa di studio per la School of American Ballet. Qui fu notato da George Balanchine, che lo scritturò nel New York City Ballet nel 1982. Già un anno dopo, nel 1983, Horiuchi danzava in ruoli principali, quali Oberon in Sogno di una notte di mezza estate. Nel 1989 fu proclamato primo ballerino della compagnia e, in questa veste, apparve con successo in coreografie di Balanchine e Jerome Robbins.
Parallelamente all'attività al New York City Ballet, dalla metà degli anni Ottanta si esibì anche in musical di Andrew Lloyd Webber. Nel 1985, infatti, esordì a Broadway danzando nella prima statunitense di Song and Dance accanto a Bernadette Peters (1985). Durante gli anni Novanta, invece, collaborò ancora con Lloyd Webber, danzando nel ruolo di Mr Mistoffelees in Cats a Tokyo nel 1995, a Sapporo nel 1997, a Londra nel 1998 e a Broadway a più riprese tra il 1991 e il 1996.
Nel giugno 1994 diede il suo addio al New York City Ballet, danzando per l'ultima volta come Oberon, e nel 1998 curò le coreografie della cerimonia di apertura dei XVIII Giochi olimpici invernali a Nagano. Nel 2000 assunse la direzione artistica del Saint Louis Ballet. Sotto la sua direzione, il repertorio della compagnia fu ampliato con coreografie di Balanchine e dello stesso Horiuchi, mentre la scuola incrementò la sua capienza, passando dai cinquanta studenti del 2000 ai 350 del 2008.