Giuppana è separata dalla costa dalmata dal canale di Calamotta o Calamota (Koločepski kanal) e si trova a sud di Slano. Il tratto di mare Bocca o Porta di Mezzo (Lopudska Vrata) la separa dall'isola di Mezzo.
L'isola ha una superficie di 16,22km², lo sviluppo costiero è di 29,416km, l'elevazione massima è quella del monte Grande o Velivark (Veli vrh), 233,8m s.l.m., che si trova a nord-ovest, segue il monte Sant'Elia (Sutulija), 223,8m, situato al centro dell'isola. L'estremità nord-ovest si chiama punta dei Sorci (rt Stari brod), poco più a est, su punta Quieta (rt Tiha) c'è una torre bianca con un fanale. L'estremità sud-est dell'isola ha tre punte: Pertusa, Pertussa o Pertuscia (rt Prtuša), Butura o Suhi Rat (rt Butor) e San Giorgio (rt Konj).
Sull'isola vi sono due porti: porto Giuppana o Luca di Giuppana o semplicemente Luca (Šipanska Luka) e porto di San Giorgio o San Giorgio di Giuppana (Suđurađ).
Il porto Giuppana si trova a ovest nella valle Luca o di Scipan (uvala Luka), che è racchiusa da una stretta penisola che si protende verso l'isola Liciniana. Il tratto di mare tra la penisola e Liciniana si chiama Bocca Pompeiana o di Pompeo o Porta Pompeiana (prolaz Harpoti).
Il porto di San Giorgio è situato a sud-est nella valle San Giorgio (uvala Suđurađ), delimitata dalle punte Butura e San Giorgio e protetta dall'isoletta Ruda.
12Natale Vadori, Italia Illyrica sive glossarium italicorum exonymorum Illyriae, Moesiae Traciaeque ovvero glossario degli esonimi italiani di Illiria, Mesia e Tracia, 2012, San Vito al Tagliamento (PN), Ellerani, p.581, ISBN978-88-85339293.
123456G. Giani, Carta prospettiva delle Comuni censuarie della Dalmazia, foglio 12, 1839. Fondo Miscellanea cartografica catastale, Archivio di Stato di Trieste.
G. Giani, Carta prospettiva delle Comuni censuarie della Dalmazia, foglio 12, 1839. Fondo Miscellanea cartografica catastale, Archivio di Stato di Trieste.