Nel 1938, il tenente generale Ernest Squires era stato nominato ispettore generale delle forze militari australiane. Lavarack e Squires lavorarono insieme per preparare l'Australia per la guerra, e Lavarack tornò da un tour in Gran Bretagna allo scoppio della seconda guerra mondiale. Lavarack venne promosso a tenente generale e Comandante Generale del comando meridionale. Nel 1940 prese il comando della 7ª Divisione, accettando anche una retrocessione a generale maggiore.
Nel 1941, il comandante in capo nel Medio Oriente, Lord Wavell, ordinò a Lavarack di posizionarsi a Tobruk, dove le sue unità riuscirono a respingere le forze di Erwin Rommel. Dopo ulteriori successi nella campagna Siria-Libano, Lavarack venne nuovamente promosso a tenente generale e ha assunto il ruolo di Blamey come comandante del I Corpo, con Blamey ora vice comandante in capo in Medio Oriente.
Nel 1946, Ned Hanlon, offrì il posto di governatore del Queensland al tenente generale Sir Leslie Morshead che rifiutò. Hanlon, poi, offrì il posto a Lavarack, che accettò e prestò giuramento il 1º ottobre 1946. Dopo aver terminato il suo mandato di cinque anni, nel 1951, il governatorato di Lavarack è stato prorogato di altri cinque anni. È stato poi riconfermato per un ulteriore anno dal 1º ottobre 1956 ma per motivi di salute, Lavarack servì solo per quattro mesi, anche se rimase ufficialmente governatore fino a settembre 1957.
.svg){kind=small}
Australia
.svg){kind=small}
