La sua prima opera, un romanzo breve intitolato Blu quasi trasparente (限りなく透明に近いブルー?, Kagirinaku tōmei ni chikai burū), che tratta della promiscuità e dell'uso di droghe tra i giovani giapponesi, vinse il premio letterario Gunzo per esordienti nel 1976. Il romanzo suscitò critiche entusiastiche, che ne esaltavano la novità nel panorama letterario, benché non mancassero voci che ne denunciavano la decadenza. Nello stesso anno Blu quasi trasparente vinse anche il premio Akutagawa ed in breve tempo divenne un best seller.
Nel 1980, Murakami pubblicò Coin Locker Babies (コインロッカー・ベイビーズ?), che raccolse nuovamente grandi consensi di critica e pubblico vincendo il Noma Literary New Face Prize l'anno successivo. Nel 2000, Parassiti (共生虫?) si è aggiudicata la 36ª edizione del Premio Tanizaki..
In data 23 ottobre 2026, la casa editrice Gentōsha annuncia la morte della scrittore, avvenuta il 17 ottobre.
Piercing (2021), Atmosphere libri, traduzione e postfazione di Gianluca Coci
KYOKO (1995)
ヒュウガ・ウイルス 五分後の世界ⅡHūga Uirusu Gofungo no Sekai Tū (1996)
メランコリアMerankoria (1996)
ラブ&ポップ トパーズⅡRabu ando Poppu Topāzu Tū (1996), LOVE & POP (2026), Atmosphere libri, traduzione e postfazione di Gianluca Coci
オーディションŌdishon (1997)
Audition (2023), Atmosphere Libri, traduzione e postfazione di Gianluca Coci
ストレンジ・デイズSutorenji Deizu (1997)
イン ザ・ミソスープIn za Misosūpu (1997)
Tokyo soup (2006), Mondadori, traduzione (dall'inglese) di K. Tashiro e K. Bagnoli; 2025, Atmosphere libri, traduzione (dal giapponese) e postfazione di Gianluca Coci
ラインRain (1998)
共生虫Kyōsei Chū (2000)
希望の国のエクソダスKibō no Kuni no Ekusodasu (2000)
タナトスTanatosu (2001)
THE MASK CLUB (2001)
最後の家族Saigo no Kazoku (2001)
半島を出よHantō o Deyo (2005)
歌うクジラ (2010)
心はあなたのもとにKokoro wa Anata no Motoni (2011)
オールド・テロリストŌrudo Terorisuto (2015)
Racconti
Raccolte di racconti
悲しき熱帯Kanashiki Nettai (1984)
POST ポップアートのある部屋Posuto Poppu Āto no aru Heya (1986)
走れ!タカハシHashire! Takahashi (1986)
ニューヨーク・シティ・マラソン (1986)
村上龍料理小説集Murakami Ryū Ryōri Shōsetsushū (1988)
恋はいつも未知なものKanashiki Nettai (1991)
村上龍映画小説集Murakami Ryū Eiga Shōsetsushū (1995)
モニカ-音楽家の夢・小説家の物語Monika – Ongakuka no Yume Shōsetsuka no Yume (1996), scritto in collaborazione con Ryūichi Sakamoto
白鳥Hakuchō (1997)
ワイン一杯だけの真実Wain Ippai dake no Shinjitsu (1998)
とおくはなれてそばにいてTōku Hanarete Soba ni ite (2003)
どこにでもある場所どこにもいないわたしDokonidemo aru Basho Dokonimo inai Watashi (2003)
At the Airport (2009), pubblicato su Zoetrope: All-Story
No Matter How Many Times I Read Your Confession, There’s One Thing I Just Don’t Understand: Why Didn’t You Kill the Woman? (2010), pubblicato su Zoetrope: All-Story
Penlight (2011), pubblicato su Zoetrope: All-Story