L'antenato degli arowana australiani, S. jardinii e S. leichardti, si separò dall'antenato degli arowana asiatici circa 140 milioni di anni fa, durante il Cretaceo inferiore. La somiglianza morfologica delle quattro specie dimostra che in questi antichi pesci si sono verificati pochi cambiamenti evolutivi recenti. Il genere ebbe una distribuzione molto più ampia durante il primo Cenozoico, con resti fossili noti del Paleocene scoperti in Niger e in Belgio, e dell'Eocene in Cina.
Nel 2003, uno studio ridescrisse diverse varietà cromatiche di S. formosus in quattro specie distinte. La maggior parte degli esperti mette in dubbio questa riclassificazione, sostenendo che i dati pubblicati sono insufficienti per giustificare il riconoscimento di più di una specie di Scleropages del Sud-est asiatico e che gli aplogruppi divergenti utilizzati per distinguere le varietà di colore siano stati rinvenuti in individui appartenenti a una sola varietà cromatica, il che contraddice le conclusioni. Essi sono considerati monotipici, vale a dire costituiti da aplogruppi strettamente correlati in base al colore.
Specie
Attualmente sono riconosciute 4 specie in questo genere:
↑L. Taverne, On the presence of the osteoglossid genus Scleropages in the Paleocene of Niger, Africa (Teleostei, Osteoglossomorpha), in Bulletin de l'Institut royal des Sciences naturelles de Belgique, Science de la Terre, vol.79, 2009, pp.161-167.
12L. Pouyaud, Sudarto e G. G. Teugels, The different colour varieties of the Asian arowana Scleropages formosus (Osteoglossidae) are distinct species: morphologic and genetic evidences, in Cybium, vol.27, n.4, 2003, pp.287-305.