登場キャラクター
この項目では色を扱っています。閲覧環境によっては、色が適切に表示されていない場合があります。
本項では名前の左側にレーダーで表示される色を記載した。なお、登場キャラクターの名前はエンディング（ステージ12クリア後）で初めて明らかにされる。
自機（プレイヤー）
- ■戦艦ヤマ卜（やまぼく、Yamaboku）
- 主役。壊滅状態となった地球に代わる第2の地球を探すために建設された宇宙戦艦。名前はかの巨大戦艦にあやかっている。
海ステージ（海中）に現れる敵機
- ■Tiddler
- 機雷を放つ潜水艦。レーダーにはオレンジ色に映る、ステージ1では5機、ステージ5では3機、ステージ9では1機。得点は50点。
- ■Asthmatic
- ミサイルを発射する潜水艦。移動スピードはTiddlerより速い。ステージ1では1機、ステージ5とステージ9では2機出現する。レーダーには赤く映る。得点は300点。
- ■Coypu
- 機雷を放つ小型の潜水艦。移動スピードは海中で最も速く左から右へと移動する。ステージ1とステージ5では1機、ステージ9では2機出現する。レーダーには黄緑色に映る。得点は200点。
- ■Wigwam
- 2周目と3周目（ステージ5，9）に登場する敵機。海底を這って移動し、一度にミサイルを4発発射する。ステージ5では1機、ステージ9では2機出現する。レーダーには紫色に映る。得点は500点。
空ステージ（空中）に現れる敵機
- ■Eyewash
- ヘリコプターの敵機。ヤマ卜の上空を漂い、垂直落下するミサイルを降らせる。レーダーにはオレンジ色に映る、ステージ2では5機、ステージ6では3機、ステージ10では1機しかでない。得点は50点。
- ■Spooky
- 旅客機に似た形状の敵機。ステージ2とステージ10では2機、ステージ6では3機登場。横へ真っ直ぐ進み、Eyewashと同じ垂直落下するミサイルを大量に降らせる。レーダーには赤く映る。得点は200点。
- ■Fratricide
- 大型ヘリコプターの敵機。上から現れ、ヤマ卜にめがけて白い弾を降らせる。その後は放物線を描くように上へ戻る。ステージ6では2機、ステージ10では3機出現する。レーダーには黄緑色に映る。得点は300点。
- ■Scourge
- 3周目（ステージ10）に現れるツクシのような形をした敵機。横へ真っ直ぐ進み、倒さずにいると自滅してヤマ卜にめがけて白い弾を5発降らせる。レーダーには紫色に映る。得点は500点。
宇宙ステージ（宇宙）に現れる敵機
- ■Mean
- 未確認飛行物体のような機体。群衆で現れるが攻撃はしてこない。レーダーにはオレンジ色に映る、ステージ11では1機しかでない、得点は50点。
- ■Chirstie
- 宇宙船の敵機。横へ真っ直ぐ進み、ヤマ卜にめがけて白い弾をばらまく。レーダーには赤く映る。得点は200点。
- ■Poppy
- 球体の敵機。倒さずにいると自滅して白い弾を2～4発ばらまく。ステージ11では2機出現する。レーダーには紫色に映る。得点は300
- ■Rob
- 2周目と3周目（ステージ7，11）に現れるサメ型の敵機。白い弾をばらまきながらヤマ卜に向けて突進してくる。ステージ7では1機、ステージ11では2～3機出現する。レーダーには黄緑色に映る。得点は500点。
ボス
- ■Eerie Core
- 1周目（ステージ4）に現れる最初のボス。画面右から登場する。左右の隅で上下に移動しながら水平方向にレーザーを4発発射し、瀕死になるとヤマ卜にゆっくり近づきながら白い弾を1発ずつばらまく。弱点は左右の赤いコアが露出している部分。耐久値は20発で、残り8発になると瀕死になる。レーダーには赤く映る。得点はヒットする度に100点（※倒壊中も換算される）、破壊すると5000点。
- ■Lunatic Noddle
- 2周目（ステージ8）に現れるヘビ型のボス。画面左から登場する。上下にN字を描いて動いている時は炎を吐き、横へ大きくZ字を描いて動いている時（瀕死）はヤマ卜にめがけて灰色の弾をばらまく。弱点は頭。耐久値は20発で、残り7発になると瀕死になる。レーダーにはオレンジ色に映る。得点はヒットする度に200点（※倒壊中も換算される）、破壊すると5000点。
- ちなみにこのヘビ型のボスは、altyがプログラミングした他のBio_100%ゲーム（「metys's Snow Wars」「NyaHaX'93」「SuperDepth2 "Finalty"」など）によく見られる形状でどれも頭が弱点である。
- ■B.P.S.M.
- 3周目（ステージ12）に現れる最後のボス。画面左から登場する。画面右隅を上下遅く動きながら中心部の青いコアから常に追尾性の青い弾を放ってくる他、両アームを広げて2本のレーザーで攻撃してくる。弱点は中心の青いコアで、普段は両アームで守っている。瀕死になるとレーザーは撃たなくなり、常に両アームを広げて上下速く動きながら青い弾をメインに攻撃するようになる。耐久値は20発で、残り9発になると瀕死になる。レーダーには水色に映る。得点はヒットする度に200点（※倒壊中も換算される）、破壊すると10000点。
その他の敵機
- ■Hoot
- （ボスステージを除く）全てのステージに現れる機体。サイン波を大きく描きながら横へ移動する。攻撃はしてこないが、倒すとパワーアップアイテムが出現する。なお2機同時に登場した場合、先に倒した方しかパワーアップアイテムは手に入らない。レーダーには白く点滅して映る。得点は100点。
- Strayed Brain
- クラゲのような機体。エンディングのみ紹介され、本編には登場しない[要出典]が、続編には似たようなキャラが雑魚キャラとして登場している。