Apache cTAKES

Apache cTAKES
개발자아파치 소프트웨어 재단
안정화 버전
6.0.0 / 2024년 9월 16일(2년 전)(2024-09-16)
저장소cTakes 저장소
프로그래밍 언어자바, 스칼라, 파이썬
운영 체제크로스 플랫폼
종류자연어 처리, 생물정보학, 텍스트 마이닝, 정보 추출
라이선스아파치 라이선스 2.0
웹사이트Apache cTAKES 위키데이터에서 편집하기 - 공식 웹사이트

Apache cTAKES: clinical Text Analysis and Knowledge Extraction System은 전자의무기록의 비정형 텍스트로부터 임상 정보를 추출하는 오픈 소스 자연어 처리(NLP) 시스템이다. 임상 노트를 처리하여 약물, 질병/질환, 징후/증상, 해부학적 부위 및 절차와 같은 임상 명명 엔티티 유형을 식별한다. 각 명명 엔티티는 텍스트 범위, 온톨로지 매핑 코드, 문맥(가족력, 현재 상태, 환자와 무관함) 및 부정/긍정 여부에 대한 속성을 갖는다.

cTAKES는 UIMA 비정형 정보 관리 아키텍처 프레임워크와 OpenNLP 자연어 처리 툴킷을 사용하여 구축되었다.

구성 요소

cTAKES의 구성 요소는 임상 도메인에 특화되어 훈련되었으며, 임상 의사 결정 지원 시스템과 임상 연구에서 활용할 수 있는 풍부한 언어 및 의미론적 주석을 생성한다.

이러한 구성 요소는 다음과 같다:

역사

cTAKES의 개발은 2006년 메이오 클리닉에서 시작되었다. 게르가나 사보바 박사와 크리스토퍼 추트 박사가 이끄는 개발팀에는 의사, 컴퓨터 과학자, 소프트웨어 엔지니어가 포함되었다. 배포 후 cTAKES는 메이오 클리닉의 임상 데이터 관리 인프라의 필수적인 부분이 되어 8천만 건 이상의 임상 노트를 처리했다.

2010년 초 사보바 박사가 보스턴 아동병원으로 자리를 옮기면서 핵심 개발팀은 그곳의 구성원들을 포함하며 성장했다. 외부 협력 기관은 다음과 같다:

이러한 협력을 통해 cTAKES의 기능은 시간적 추론, 임상 질의 응답, 임상 도메인을 위한 공지시어 분석(coreference resolution)과 같은 다른 영역으로 확장되었다.

2010년, cTAKES는 i2b2 프로그램에 채택되었으며 SHARP Area 4의 핵심 구성 요소가 되었다.

2013년, cTAKES는 아파치 소프트웨어 재단의 인큐베이터 프로젝트로서 첫 번째 릴리스인 cTAKES 3.0을 발표했다.

2013년 3월, cTAKES는 아파치 소프트웨어 재단의 최상위 프로젝트(TLP)가 되었다.

같이 보기

각주

  1. ↑ Denecke, Kerstin (2015년 8월 31일). 〈Tools and Resources for Information Extraction〉. 《Health Web Science: Social Media Data for Healthcare》. Springer. 67쪽. ISBN 978-3-319-20582-3 – Google Books 경유.
  2. ↑ Khalifa, Abdulrahman; Meystre, Stéphane (2015년 12월 1일). “Adapting existing natural language processing resources for cardiovascular risk factors identification in clinical notes”. 《Journal of Biomedical Informatics》. Proceedings of the 2014 i2b2/UTHealth Shared-Tasks and Workshop on Challenges in Natural Language Processing for Clinical Data 58 (Supplement): S128–S132. doi:10.1016/j.jbi.2015.08.002. PMC 4983192. PMID 26318122.
  3. ↑ Khudairi, Sally (2017년 4월 25일). “The Apache Software Foundation Announces Apache® cTAKES™ v4.0” (보도자료). Forest Hill, MD: The Apache Software Foundation. Globe Newswire. 2017년 9월 20일에 확인함.
  4. ↑ Savova, Guergana K; Masanz, James J; Ogren, Philip V; Zheng, Jiaping; Sohn, Sunghwan; Kipper-Schuler, Karin C; Chute, Christopher G (2010). “Mayo clinical Text Analysis and Knowledge Extraction System (cTAKES): architecture, component evaluation and applications”. 《Journal of the American Medical Informatics Association》 17 (5): 507–513. doi:10.1136/jamia.2009.001560. ISSN 1067-5027. PMC 2995668. PMID 20819853.
  5. 1 2 3 4 5 “History”. 《Apache cTAKES™ - clinical Text Analysis Knowledge Extraction System》. 2015년 6월 22일. 2020년 5월 6일에 원본 문서에서 보존된 문서. 2018년 1월 11일에 확인함.

외부 링크