GenBank
GenBank is een openbare databank voor nucleotidesequenties van DNA en RNA van uiteenlopende organismen. De databank wordt beheerd door het Amerikaanse National Center for Biotechnology Information (NCBI), dat onderdeel is van de National Institutes of Health (NIH). GenBank bevat genetische sequenties met bijbehorende informatie over onder meer de herkomst, betrokken genen en wetenschappelijke publicaties.
Volgens GenBank-release 274.0 (oktober 2026) bevatte de databank ongeveer 7,01 miljard sequentierecords, met in totaal 65,39 biljoen basenparen. Daarvan waren 269.895.537 traditionele GenBank-records, die samen ruim 9,38 biljoen basenparen omvatten. De databank bevat genetische gegevens van meer dan 581.000 formeel beschreven soorten, waaronder gegevens van volledige genomen en transcriptomen. De sequenties zijn afkomstig van rechtstreekse inzendingen door individuele laboratoria en grootschalige sequentieprojecten.
Geschiedenis
GenBank werd in 1982 opgericht bij het Los Alamos National Laboratory in de Verenigde Staten. De ontwikkeling kwam voort uit eerdere initiatieven van onder anderen de Amerikaanse wetenschapper Walter Goad om genetische sequenties digitaal te verzamelen en toegankelijk te maken voor wetenschappelijk onderzoek.
Internationale samenwerking
GenBank maakt deel uit van de International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC), samen met de DNA Data Bank of Japan (DDBJ) en het Europese European Nucleotide Archive (ENA). Deze drie databanken wisselen dagelijks gegevens uit, waardoor genetische sequenties wereldwijd beschikbaar worden gesteld.
Gebruik
GenBank wordt gebruikt voor onderzoek binnen onder meer de genetica, moleculaire biologie, evolutiebiologie en taxonomie. Onderzoekers kunnen DNA-sequenties vergelijken om genetische verwantschappen te onderzoeken, organismen te identificeren en genen te bestuderen.
Elke ingediende sequentie krijgt een uniek identificatienummer, een zogenoemd accession number. Met dit nummer kan de betreffende sequentie worden teruggevonden en geraadpleegd. Sequenties kunnen onder andere worden doorzocht met BLAST, een programma waarmee overeenkomsten tussen biologische sequenties worden opgespoord.
Externe link
- 1 2 (en) GenBank Overview – National Center for Biotechnology Information.
- ↑ (en) GenBank Release 274.0 – NCBI, 15 oktober 2026.
- ↑ (en) Sayers et al. (2025). GenBank 2025 update – Nucleic Acids Research, 53(D1), D56–D61.
- ↑ (en) Walter Goad Papers – American Philosophical Society
- ↑ (en) About GenBank – National Center for Biotechnology Information.
