Marius Flothuis werd in 1937 assistent-artistiek leider van het Concertgebouw in Amsterdam. In 1942 moest hij zijn loopbaan afbreken omdat hij weigerde te gehoorzamen aan de Duitse bezetter. Hij werd actief in het verzet en verborg Joodse onderduikers. In september 1943 werd hij gearresteerd en via Kamp Vught in september 1944 gedeporteerd naar concentratiekamp Sachsenhausen.
Van 1946 tot 1950 was hij bibliothecaris bij de Stichting Donemus, van 1945 tot 1953 muziekrecensent van Het Vrije Volk. In 1953 trad Flothuis in dienst van het Concertgebouworkest, waarvan hij van 1955 tot 1974 als artistiek leider het muzikale beleid mede bepaalde. Daarnaast was Marius Flothuis van 1974 tot 1983 hoogleraar musicologie aan de Universiteit van Utrecht. Flothuis genoot internationale reputatie vanwege zijn studies over Mozart. Van 1980 tot 1994 was hij voorzitter van het Zentralinstitut für Mozart-Forschung te Salzburg. Hij gold als een autoriteit op het terrein van Mozarts muziek en schreef cadensen voor een aantal van diens concerten.
Als componist is Flothuis grotendeels autodidact. Hij componeerde in een behoudend idioom. Pas in de jaren zestig kwam hij hiervan los en volgde hij als componist meer zijn intuïtie. In zijn ruim honderd opusnummers beleed hij openlijk zijn voorliefde voor Franse componisten als Debussy en Ravel. Zijn composities in vrijwel alle genres hebben weinig van doen met de turbulente tijden van het modernisme waar Flothuis ook als componist midden in zat. Ze spreken eerder fijnzinnig en beknopt van universele waarden en klassiek evenwicht, zaken waar Flothuis ook in woord en geschrift voor stond.
Tot het einde van zijn leven maakte Flothuis actief deel uit van het Nederlandse muziekleven.
Composities
Werken voor orkest
1939-1940Concertino, voor fluit, hobo, klarinet, saxofoon, trompet, pauken, piano en strijkorkest, opus 8
1946Cantata Silesiana, voor driestemmig vrouwenkoor, fluit, strijkquartet en klavecimbel, opus 29 - tekst: Angelus Silesius
1948-1949Love and strife, a serious cantata for contralto, flute, oboe d'amore (also oboe), viola and 'cello, opus 34 - words by Kathleen Raine
Mourning in spring 1943
Sorrow
Heroes
Interlude
Venus
The moment
Winged eros
1951Een Amsterdamsch lied, cantate voor sopraan- en bariton-solo, fluit, klarinet, twee violen, altviool, violoncel, contrabas en piano , opus 40 - tekst: Jan Campert
1968Fantasia quasi una cantata, per 12 strumenti ad arco, clavicembalo e mezzo-soprano, opus 71 - tekst: Andri Peer
1944Bicinia, voor tweestemmig vrouwenkoor met of zonder begeleiding (2 violen, hobo en altviool, 2 fluiten, 2 althobo's, 2 klarinetten of andere combinaties), opus 20
1933/1949Het lied van 't dagelijks brood, voor gemengd koor, opus 36 no.2 - tekst: Bruno Schönlank
1951Vier antieke fragmenten, voor a capella gemengd koor, opus 41
Voorzang - tekst: Terpander
Avondlied - tekst: Alkman
Spreuk - tekst: Simonides
Danslied - tekst: Alkman
1952Lente, voor mannenkoor a capella, opus 36 nr. 3
1945-1947Tricinia, voor tenor, bariton en bas, opus 25
1947-1948To an old love, voor mezzo sopraan en orkest, opus 32 - tekst: Ellen Marsh
1948-1950Four trifles, voor een hoge stem en klein orkest, opus 33
1949-1951Zes Nederlandse volksliederen - Serie I, voor 2 stemmen, opus 43
1951Zes Nederlandse minneliederen - Serie III, voor zangstem en 2 instrumenten, opus 43
1952 Kleine suite (vocalises), voor sopraan en piano, opus 47
Maestoso
Con grazia, non troppo vivo
Molto tranquillo
Vivace e leggiero
Lento grazioso
1952/1995Kleine suite (vocalises), voor sopraan, fluit, viool, altviool, violoncello en harp, opus 47a
1953Negro lament, voor contralt, altsaxofoon en piano, opus 49 - tekst: Langston Hughes
Proem
Harlem night song
Troubled woman
The white ones
Roland Hayes beaten (Georgia: 1942)
Epilogue
1958-1960Odysseus and Nausikaa, madrigal voor sopraan, alt, tenor, baritone en harp, opus 60 - tekst van Homerus in vertaling van E.V. Rieu en fragmenten van Alkman en Sappho
1965Hymnus, voor sopraan en groot orkest, opus 67 - tekst: Ingeborg Bachmann, "An die Sonne"
1978Hommage à Mallarmé, voor chant, flûte, violoncelle et piano, opus 80 - tekst: Stéphane Mallarmé
1983Vrijheid, voor gemengd koor, 2 recitanten, mezzo-sopraan, fluit en strijkorkest, opus 83
Introitus
Koor
Canon
Lied
Koraal en Arioso
Lied (herhaling)
Intermezzo
Finale en coda
1988November, drei Lieder nach deutschen Gedichten für Mezzosopran und Klavier, opus 90
1992... ein fremdes Völkchen ..., Gedichte von Rose Ausländer für vier Frauenstimmen (2 sopranen en 2 alten) gesetzt, Opus 95
1996Drei Lieder nach Gedichten von Günter Eich, voor mezzosopraan en piano, opus 99
Wie grau es auch regnet
Die Totentrompete
Die Häherfeder
1996-1997Drei Lieder nach Gedichten von Günter Eich, versie voor mezzosopraan en klein ensemble, opus 99a
1997Adagio, für Streichorchester und Sprecherin, Opus 100 - tekst: Sophie Scholl
2001Saraband, voor mezzo sopraan en harp, opus 103
Marius Flothuis: ... exprimer l'inexprimable ..., essai sur la mélodie française depuis Duparc, en dix-neuf chapitres et huit digressions, Amsterdam 1996
Marius Flothuis: Mozarts Klavierkonzerte - Ein musikalischer Werkführer, München 1998
Marius Flothuis: Mozarts Streichquartette - Ein musikalischer Werkführer, München 1998
Marius Flothuis: 'Autograph - Abschrift - Erstdruck. Eine kritische Bewertung', in: Mozart-Jahrbuch 2001, Kassel 2003
Kiliaan, Joyce: ‘Marius Flothuis und deutsche Kultur’, in: Fliessende Übergänge. Historische und theoretische Studien zu Musik und Literatur, Amsterdam 1997, p. 53-88
Kiliaan, J.A.: Marius Flothuis, Donemus Uitgeverij en Bibliotheek van eigentijdse Nederlandse Muziek, Amsterdam 1999
Kiliaan, Joyce: ‘Vorser, vernieuwer, behoeder’: in Preludium, oktober 2014, p. 22-24
Kiliaan, Joyce: ‘Flothuis: Cantus amoris’, in: Preludium, oktober 2014, p. 51-52 [programmatoelichting]
Kiliaan, J.A.: ‘Marius Flothuis – Componist, wetenschapper en humanist’, in: Carine Alders en Eleonore Pameijer (eds.), Vervolgde componisten in Nederland. Verboden muziek in de Tweede Wereldoorlog, Amsterdam 2015, p. 79-86
Kiliaan, J.A.: ‘Marius Flothuis – Komponist, Wissenschaftler und Humanist’, in: Carine Alders, Eleonore Pameijer (Hg.), Verfolgte Komponisten in den Niederlanden. Verbotene Musik im Zweiten Weltkrieg, Berlin, Leipzig 2020, p. 70-77
Kiliaan, J.A.: 'Echte helden hoor je zelden', tekst van een lezing door Joyce Kiliaan in het Verzetsmuseum te Amsterdam op 21 november 2019. [over Marius Flothuis en Lex van Delden] *
Beynon, Emily: ‘An Introduction to Marius Flothuis (1914-2001)’, in: The New York Flute Club Newsletter, January 2021, p. 4-5, p. 7