De oorsprong van het kapittel gaat terug tot de middeleeuwen, toen geestelijken prebenden kregen die zich verenigden rondom het graf van Sint-Rombout. Tijdens de napoleontische oorlogen werd het kapittel opgeheven, de kanunniken verloren hun prebenden en voorrechten. In 1803 erkende de paus opnieuw het kapittel, het werd opnieuw opgericht in de kathedraal.
De Belgische staat voorziet vandaag twee extra prebenden voor dit kapittel. Daarom waren er vroeger twaalf kanunniken in plaats van tien.
Mgr. de Pradt, archevêque de Malines et le chapitre métropolitain
Kapittel der metropolitaine kerk van Mechelen, bij openstaande stoel, aan de geestelijkheid en geloovigen van het aartsbisdom, zaligheid in onzen heer Jesus-Christus.- Victor Maria Van den Branden de Reeth, Joseph Frans Van Der Stappen, J. Jacops: 1906