De gemeente Bodegraven-Reeuwijk voert geen officiële vlag. Wel gebruikt de gemeente een logovlag in het formaat van een baniervlag.
De onofficiële vlag - die door de inwoners gebruikt wordt - heeft twee banen van gelijke hoogte in geel en blauw.
De vlag lijkt sterk op de vlag van Bodegraven, de voorganger van deze gemeente die in 2011 fuseerde met Reeuwijk.
