Haldanes regel, som er oppkalt etter J. B. S. Haldane, innebærer at hybrider av det kjønn som bærer det kjønnsbestemmende kromosomet i større grad utsettes for sterilitet og har lavere fitness enn avkom av det motsatte kjønn. Hos pattedyr gjelder det hannene, hos fugler hunnene.
Fenomenet ser ut til å skyldes at recessive gener på X hhv Z-kromosomene ikke er kompatible med den andre artens gener. Slike gener kommer til uttrykk i kjønnet med ulike kjønnskromosomer siden de bare har ett X(Z)-kromosom, men overstyres av dominante gener i kjønnet med like kjønnskrommosomer (XX og ZZ) som dermed klarer seg bedre.