Handnesholmen er en holme i Nesna kommune i Nordland. Holmen ligger utenfor Handnes på sørspissen av Handnesøya, derav navnet. Holmen danner Handnessundet mellom Handnesholmen og fergeleiet på Handes.
Holmen er flat og gresskledd. Holmen er ikke bebodd og benyttes til sauebeite.
Like sør for holmen er Handnesholmen fyrlykt plassert.