Stiftsdireksjonen var en norsk offentlig myndighet som i hvert bispedømme («stift») besto av biskopen og den fylkesmannen som hadde sete i stiftsstaden (tidligere stiftamtmannen).
Stiftsdireksjonens oppgaver var oppsyn med kirkebygninger, kirkegårder, prestegårder, off. hospitaler og veldedige stiftelser. Den var også den øverste geistlige administrasjon i hvert enkelt bispedømme.
Stiftsdireksjonen ble avviklet da det kom en kirkelov i 1997, og forvaltning og tilsyn med den lokale kirke er overført til bispedømmerådene.