Studiował medycynę w Berlinie, Heidelbergu, Wiedniu i Paryżu. Tytuł doktora medycyny uzyskał w 1881. Następnie był asystentem w instytutach patologicznych w Halle (Saale) i Getyndze oraz w Instytucie Fizjologicznym w Berlinie. W 1888 habilitował się z anatomii w Berlinie. Od 1894 do 1907 prosektor w Stadt-Krankenhaus am Urban, od 1899 profesor tytularny. Od 1908 do 1925 prosektor w Instytucie Patologii szpitala Moabit. W 1921 został profesorem honorowym, w 1925 przeszedł na emeryturę. Zmarł w maju 1932. Jego synem był lekarz Clemens Ernst Benda (1898–1975).
W 1898, używając fioletu krystalicznego, uwidocznił w preparatach histologicznych struktury, którym nadał nazwę mitochondriów – używaną do dziś. W 1901 roku wykazał, że w przysadce u chorych z akromegalią guz w płacie przednim utworzony jest z chromofilnych (kwasochłonnych) komórek.
Wybrane prace
Zur Statistik der Conjunctivitis blennorrhoica. Berlin: Schade, 1880
Carl Benda, Paula Günther. Histologischer Handatlas. Franz Deuticke, Wien-Leipzig 1895
Die Dentinbildung in den Hautzähnen der Selachier. (1881)
Untersuchungen über den Bau des funktionirenden Samenkanälchens einiger Säugethiere und Folgerungen für die Spermatogenese dieser Wirbelthierklasse. (1887)
Untersuchungen über die Elemente des Molluscum contagiosum (1895)
↑Victor CorneliusMedvei:The history of clinical endocrinology.Carnforth, Lancs, UK:Pearl River, N.Y.: Parthenon Pub. Group,1993,s.167. ISBN1-85070-427-9.
↑CarlC.BendaCarlC., Die Dentinbildung in den Hautzähnen der Selachier, „Archiv für mikroskopische Anatomie”, 20 (1), 1881, s. 246–270, DOI:10.1007/BF02952649, ISSN0176-7364(niem.).
↑CarlC.BendaCarlC., Untersuchungen über den Bau des funktionirenden Samenkanälchens einiger Säugethiere und Folgerungen für die Spermatogenese dieser Wirbelthierklasse, „Archiv für mikroskopische Anatomie”, 30 (1), 1887, s. 49–110, DOI:10.1007/BF02955609, ISSN0176-7364(niem.).