O Bioconductor é um projeto de software livre, de código aberto e de desenvolvimento aberto para análise e compreensão de dados genômicos gerados por experimentos em laboratórios na área de biologia molecular.
O Bioconductor é baseado principalmente na linguagem de programação estatística R, mas também contém contribuições em outras linguagens de programação. Ele tem dois lançamentos a cada ano que seguem os lançamentos semestrais do R. A qualquer momento, há uma versão de lançamento, que corresponde à versão lançada do R, e uma versão de desenvolvimento, que corresponde à versão de desenvolvimento do R. Além disso, existem muitos pacotes de anotação de genoma disponíveis que são principalmente, mas não exclusivamente, orientados para diferentes tipos de microarranjos.
Enquanto métodos computacionais continuam a ser desenvolvidos para interpretar dados biológicos, o projeto Bioconductor é um repositório de software de código aberto que hospeda uma ampla gama de ferramentas estatísticas desenvolvidas no ambiente de programação R. Utilizando uma rica variedade de recursos estatísticos e gráficos em R, muitos pacotes do Bioconductor foram desenvolvidos para atender a várias necessidades de análise de dados. O uso desses pacotes fornece uma compreensão básica da linguagem de programação/comando R. Como resultado, o R e os pacotes do Bioconductor, que têm um forte histórico de computação, são usados pela maioria dos biólogos que se beneficiarão significativamente de sua capacidade de analisar conjuntos de dados. Todos esses resultados fornecem aos biólogos acesso fácil à análise de dados genômicos sem a necessidade de experiência em programação.
O projeto foi iniciado no outono de 2001 e é supervisionado pela equipe principal do Bioconductor, baseada principalmente no Fred Hutchinson Cancer Research Center, com outros membros vindos de instituições internacionais.
. PMID 15461798. doi:10.1186/gb-2004-5-10-r80
