Cinco assembleias podem ser distinguidas no cladograma em nível de género de Echimyini:
Echimys está intimamente relacionado com Phyllomys, Makalata, Pattonomys e Toromys . Este clado está de acordo com o fato de que Phyllomys foi classificado dentro de Echimys, e que Pattonomys e Toromys foram colocados em Makalata .
Dactylomys, Olallamys e Kannabateomys compartilham características únicas, e esses ratos de bambu da América do Sul são agrupados sob o nome de clado informal de "Dactylomyines".
Diplomys e Santamartamys são grupos irmãos, refletindo o fato de que o último género foi separado do primeiro.
Lonchothrix e Mesomys são grupos irmãos, e muitas vezes foram classificados como "Eumysopines", uma subfamília que se mostra polifilética .
Isothrix ocupa uma posição isolada e com ramificações profundas.
1234Fabre, Pierre-Henri; Patton, James L.; Leite, Yuri L. R. (2016). «Family Echimyidae (hutias, South American spiny-rats and coypu)». In: Wilson; Lacher; Mittermeier. Handbook of the Mammals of the World. Vol 6. Lagomorphs and Rodents I. Barcelona: Lynx Edicions. pp.552–641. ISBN978-84-941892-3-4A referência emprega parâmetros obsoletos |localização= (ajuda)
12Fabre, Pierre-Henri; Upham, Nathan S.; Emmons, Louise H.; Justy, Fabienne; Leite, Yuri L. R.; Loss, Ana Carolina; Orlando, Ludovic; Tilak, Marie-Ka; Patterson, Bruce D. (1 de março de 2017). «Mitogenomic Phylogeny, Diversification, and Biogeography of South American Spiny Rats». Molecular Biology and Evolution. 34 (3): 613–633. ISSN0737-4038. PMID28025278. doi:10.1093/molbev/msw261
↑Emmons, Louise Hickock (2005). «A revision of the genera of arboreal Echimyidae (Rodentia: Echimyidae, Echimyinae), with descriptions of two new genera». Mammalian Diversification: From Chromosomes to phylogeography (A Celebration of the Career of James L. Patton). 133. [S.l.]: University of California Press. pp.247–310. ISBN9780520098534